More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5268 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5268  propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 531 aa  1086    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2761  propionyl-CoA carboxylase  65.41 
 
 		 532 aa  697    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134901  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1977  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  55.72 
 
 		 534 aa  600  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000665967  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1385  propionyl-CoA carboxylase  53.7 
 
 		 547 aa  598  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11672  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1470  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  58.24 
 
 		 533 aa  595  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1403  Propionyl-CoA carboxylase  55.14 
 
 		 535 aa  592  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30520  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  56.02 
 
 		 537 aa  593  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.805243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6230  Propionyl-CoA carboxylase  56.02 
 
 		 533 aa  592  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2154  methylcrotonoyl-CoA carboxylase  56.14 
 
 		 529 aa  590  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0948  propionyl-CoA carboxylase  54.58 
 
 		 541 aa  585  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00939936  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4047  propionyl-CoA carboxylase  55.99 
 
 		 553 aa  585  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.257974  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1703  propionyl-CoA carboxylase  55.14 
 
 		 535 aa  587  1e-166  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.966803  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3154  propionyl-CoA carboxylase  53.27 
 
 		 535 aa  583  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.662838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4065  propionyl-CoA carboxylase  54.28 
 
 		 535 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.115987  hitchhiker  0.0000107516 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3264  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  54.58 
 
 		 541 aa  581  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.399585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1072  methylcrotonyl-CoA carboxylase carboxyl transferase subunit  51.4 
 
 		 554 aa  578  1e-164  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.19286  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1776  propionyl-CoA carboxylase  54.09 
 
 		 535 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212447 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3290  carboxyl transferase  52.78 
 
 		 535 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03804  acyl-CoA carboxyltransferase beta chain  52.7 
 
 		 536 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1811  propionyl-CoA carboxylase  54.28 
 
 		 535 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141567  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0749  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  52.52 
 
 		 535 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.775046  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3663  propionyl-CoA carboxylase  54.09 
 
 		 535 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.000000000713312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2552  propionyl-CoA carboxylase  55.01 
 
 		 516 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.15771  normal  0.616965 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0197  Propionyl-CoA carboxylase  52.68 
 
 		 536 aa  573  1.0000000000000001e-162  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.300462  normal  0.988787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2782  propionyl-CoA carboxylase  52.53 
 
 		 534 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0964  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  51.02 
 
 		 535 aa  573  1.0000000000000001e-162  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12524  acetyl-/propionyl-CoA carboxylase beta subunit accD1  54.17 
 
 		 529 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.145855 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3636  propionyl-CoA carboxylase  55.03 
 
 		 516 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.815282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2469  propionyl-CoA carboxylase  53.08 
 
 		 535 aa  568  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134368  normal  0.0137323 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3657  propionyl-CoA carboxylase  53.64 
 
 		 535 aa  570  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361047  normal  0.0266441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1527  propionyl-CoA carboxylase  54.39 
 
 		 557 aa  570  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2162  propionyl-CoA carboxylase  54.21 
 
 		 533 aa  570  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0218369  normal  0.667936 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3631  propionyl-CoA carboxylase  54.83 
 
 		 516 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6413  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  56.55 
 
 		 522 aa  569  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0804402  normal  0.0134377 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3704  propionyl-CoA carboxylase  54.83 
 
 		 516 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488669  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2738  carboxyl transferase domain protein  52.6 
 
 		 535 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2055  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  51.78 
 
 		 535 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.370981  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0803  carboxyl transferase domain-containing protein  51.78 
 
 		 535 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2611  Propionyl-CoA carboxylase  55.17 
 
 		 535 aa  566  1e-160  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1607  carboxyl transferase domain-containing protein  51.78 
 
 		 535 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4091  propionyl-CoA carboxylase  54.81 
 
 		 516 aa  567  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2534  propionyl-CoA carboxylase  52.81 
 
 		 534 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1532  propionyl-CoA carboxylase  52.36 
 
 		 532 aa  566  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0653  carboxyl transferase domain-containing protein  51.78 
 
 		 535 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390861  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3852  Propionyl-CoA carboxylase  54.3 
 
 		 539 aa  567  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.814993  normal  0.205657 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38460  acyl-CoA carboxyltransferase beta chain  55.02 
 
 		 535 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.509026 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0541  carboxyl transferase domain-containing protein  51.78 
 
 		 535 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0147  propionyl-CoA carboxylase  55.01 
 
 		 503 aa  565  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3467  propionyl-CoA carboxylase  51.59 
 
 		 535 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110057  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1602  methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  50.47 
 
 		 535 aa  563  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0470  carboxyl transferase domain-containing protein  51.59 
 
 		 535 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2032  propionyl-CoA carboxylase  52.97 
 
 		 535 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0210528  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02413  methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  50.56 
 
 		 535 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2829  propionyl-CoA carboxylase  51.4 
 
 		 535 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0948  carboxyl transferase domain-containing protein  52.15 
 
 		 535 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0961  propionyl-CoA carboxylase  51.21 
 
 		 535 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0351  propionyl-CoA carboxylase  53.61 
 
 		 535 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000829732 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1958  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase  51.59 
 
 		 535 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2100  Propionyl-CoA carboxylase  53.68 
 
 		 541 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.414224  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4377  Propionyl-CoA carboxylase  52.93 
 
 		 536 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2395  propionyl-CoA carboxylase  51.96 
 
 		 535 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.955899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1671  carboxyl transferase  51.78 
 
 		 535 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2847  propionyl-CoA carboxylase  51.31 
 
 		 535 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3433  Propionyl-CoA carboxylase  53.35 
 
 		 531 aa  561  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1896  3-methylcrotonyl CoA carboxylase, beta subunit  51.4 
 
 		 535 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2974  propionyl-CoA carboxylase  51.12 
 
 		 535 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.562625 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1457  propionyl-CoA carboxylase  51.21 
 
 		 535 aa  558  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.883387 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1718  propionyl-CoA carboxylase  51.49 
 
 		 535 aa  559  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4047  putative acyl-CoA carboxylase, beta chain  52.16 
 
 		 535 aa  560  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211898  normal  0.269078 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2934  propionyl-CoA carboxylase  53.2 
 
 		 534 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.126477  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2798  propionyl-CoA carboxylase  50.84 
 
 		 553 aa  560  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3224  propionyl-CoA carboxylase  52.05 
 
 		 535 aa  559  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.809195  normal  0.0163606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2125  propionyl-CoA carboxylase  51.86 
 
 		 547 aa  561  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0244689  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2323  propionyl-CoA carboxylase  51.59 
 
 		 535 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2123  propionyl-CoA carboxylase  52.23 
 
 		 535 aa  561  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1529  Propionyl-CoA carboxylase  51.12 
 
 		 535 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3763  propionyl-CoA carboxylase  51.13 
 
 		 534 aa  560  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1875  propionyl-CoA carboxylase  52.33 
 
 		 538 aa  560  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3275  acyl-CoA carboxyltransferase subunit beta  54.28 
 
 		 535 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19329  predicted protein  52.14 
 
 		 597 aa  559  1e-158  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0319191  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  55.21 
 
 		 531 aa  558  1e-158  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.123454  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3561  propionyl-CoA carboxylase  50.47 
 
 		 535 aa  558  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.507215 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1790  hypothetical protein  50.09 
 
 		 535 aa  557  1e-157  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1516  propionyl-CoA carboxylase  52.52 
 
 		 535 aa  555  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4687  Propionyl-CoA carboxylase  50.47 
 
 		 535 aa  557  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.900437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2808  Propionyl-CoA carboxylase  53.18 
 
 		 534 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1357  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  53.23 
 
 		 526 aa  555  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.642597  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6511  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  51.42 
 
 		 536 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819458  normal  0.215888 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5033  propionyl-CoA carboxylase  51.02 
 
 		 535 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3128  propionyl-CoA carboxylase  51.02 
 
 		 535 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0763689  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2728  propionyl-CoA carboxylase  50.84 
 
 		 535 aa  555  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4587  propionyl-CoA carboxylase  51.02 
 
 		 535 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3044  Propionyl-CoA carboxylase  51.13 
 
 		 534 aa  558  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.932612  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5239  propionyl-CoA carboxylase  51.02 
 
 		 535 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.954301  normal  0.755359 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0145  propionyl-CoA carboxylase  49.53 
 
 		 546 aa  553  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1465  propionyl-CoA carboxylase  49.35 
 
 		 535 aa  551  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1605  carboxyl transferase  52.52 
 
 		 534 aa  554  1e-156  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.811146  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4354  propionyl-CoA carboxylase  51.5 
 
 		 534 aa  554  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2246  propionyl-CoA carboxylase  51.21 
 
 		 552 aa  554  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0340  propionyl-CoA carboxylase  50.65 
 
 		 536 aa  553  1e-156  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>