More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5330 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
608 aa  1258    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  45.5 
 
 
725 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  45.5 
 
 
725 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  44.8 
 
 
1656 aa  484  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  46.13 
 
 
2791 aa  482  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  42.95 
 
 
611 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  43.83 
 
 
2762 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  44.27 
 
 
2997 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  40.92 
 
 
614 aa  471  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  46.05 
 
 
1067 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  43.4 
 
 
592 aa  450  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  42.73 
 
 
2820 aa  443  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  44.17 
 
 
586 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  41.21 
 
 
596 aa  442  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  43.22 
 
 
1474 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  44.65 
 
 
579 aa  431  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  43.41 
 
 
578 aa  426  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  41.47 
 
 
2721 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  43.69 
 
 
6403 aa  419  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  43.43 
 
 
2103 aa  422  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  41.14 
 
 
599 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  41.26 
 
 
581 aa  409  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  42.41 
 
 
581 aa  408  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  38.89 
 
 
588 aa  403  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  42.63 
 
 
4317 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  40.36 
 
 
991 aa  400  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2789  AMP-binding domain-containing protein  39.19 
 
 
617 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.472303  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1161  saframycin Mx1 synthetase B  39.19 
 
 
617 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  42.63 
 
 
4317 aa  399  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  43.01 
 
 
4317 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2943  Acyl-CoA synthetases  40.03 
 
 
617 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  42.26 
 
 
4332 aa  395  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0276  AMP-binding domain-containing protein  38.56 
 
 
620 aa  393  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0433  AMP-binding enzyme family protein  39.64 
 
 
559 aa  389  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  38.92 
 
 
597 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  38.92 
 
 
597 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  40.93 
 
 
2250 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  41.71 
 
 
4342 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1754  acyl-CoA synthetase  39.64 
 
 
564 aa  390  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  41.7 
 
 
4342 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  40.14 
 
 
1753 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  42.02 
 
 
4317 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  40.87 
 
 
4336 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  42.83 
 
 
1789 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  42.37 
 
 
4318 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  42.09 
 
 
3208 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  40.18 
 
 
3235 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  40.28 
 
 
3231 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  39.48 
 
 
755 aa  375  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  40.52 
 
 
4336 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  40.41 
 
 
1776 aa  372  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  41.4 
 
 
610 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  41.48 
 
 
599 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  38.99 
 
 
602 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  41.59 
 
 
610 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  41.48 
 
 
599 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  37.67 
 
 
595 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  41.4 
 
 
610 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6079  AMP-dependent synthetase and ligase  38.87 
 
 
555 aa  365  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  hitchhiker  0.00908459 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  41.48 
 
 
599 aa  365  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2989  AMP-dependent synthetase and ligase  38.64 
 
 
593 aa  362  1e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  39.04 
 
 
1801 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  39.36 
 
 
6889 aa  353  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0750  acyl-CoA dehydrogenase  38.75 
 
 
1291 aa  353  5e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0658  acyl-CoA dehydrogenase  38.75 
 
 
1283 aa  353  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523537  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8830  peptide synthetase  37.99 
 
 
574 aa  352  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426227  decreased coverage  0.000549729 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2039  polyketide synthase  38.86 
 
 
1276 aa  349  8e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  37.59 
 
 
706 aa  347  3e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01920  putative transmembrane protein  38.15 
 
 
559 aa  347  4e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.467911  normal  0.0185745 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  37.91 
 
 
1323 aa  343  7e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4760  AMP-dependent synthetase and ligase  37.85 
 
 
597 aa  342  8e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  37.98 
 
 
1272 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1218  AMP-binding domain-containing protein  40.44 
 
 
606 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3127  acyl-CoA synthetase  34.17 
 
 
576 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274694  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3109  aspartate racemase  39.37 
 
 
1981 aa  336  7e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3394  acyl-CoA synthetase  36 
 
 
577 aa  336  7.999999999999999e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.682932  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2099  AMP-binding domain-containing protein  38.46 
 
 
622 aa  335  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335161  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11562  acyl-CoA synthetase  36.38 
 
 
584 aa  335  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  38.32 
 
 
1779 aa  334  3e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2154  AMP-binding domain-containing protein  38.19 
 
 
621 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1459  AMP-binding domain-containing protein  38.19 
 
 
621 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0838  AMP-binding domain-containing protein  38.19 
 
 
621 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0523  AMP-binding enzyme  38.19 
 
 
621 aa  329  9e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.746199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1849  AMP-binding domain-containing protein  38.02 
 
 
621 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0427  AMP-binding enzyme  38.02 
 
 
621 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  36.88 
 
 
609 aa  327  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5768  AMP-dependent synthetase and ligase  36.93 
 
 
1292 aa  326  7e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  37.24 
 
 
582 aa  325  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2005  putative syringomycin synthetase  38.19 
 
 
6271 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  38.19 
 
 
6274 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2025  putative syringomycin synthetase  38.19 
 
 
6272 aa  323  6e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11209  acyl-CoA synthetase  35.12 
 
 
578 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12944  acyl-CoA synthetase  35.21 
 
 
626 aa  319  1e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1168  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.56 
 
 
629 aa  318  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.22 
 
 
629 aa  319  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1670  AMP-binding domain-containing protein  40.44 
 
 
605 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1588  AMP-binding domain-containing protein  40.44 
 
 
605 aa  318  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0181  peptide synthetase NRPS5-4-3  40.64 
 
 
1005 aa  317  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.757784  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  37.82 
 
 
4268 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11554  acyl-CoA synthetase  35.04 
 
 
583 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>