15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5348 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007950  Bpro_5348  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  537  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.109769 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4359  putative cytoplasmic protein  35.38 
 
 
546 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000209725  hitchhiker  2.2627499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0461  HNH endonuclease  37.5 
 
 
145 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000201812  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0309  HNH endonuclease domain-containing protein  34.15 
 
 
460 aa  58.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.201927  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0549  HNH endonuclease domain-containing protein  39.73 
 
 
392 aa  52.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.663462  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0610  HNH endonuclease  39.73 
 
 
392 aa  52.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2725  HNH endonuclease domain-containing protein  38.36 
 
 
382 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.881817  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1481  HNH endonuclease domain-containing protein  38.36 
 
 
382 aa  52  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0438978  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03293  hypothetical protein  29.82 
 
 
392 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0067205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0273  type VI secretion system effector, Hcp1 family  29.82 
 
 
392 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3921  HNH endonuclease domain-containing protein  29.82 
 
 
392 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3883  HNH endonuclease domain protein  29.84 
 
 
399 aa  48.5  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03246  hypothetical protein  29.82 
 
 
392 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00723229  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3641  HNH endonuclease domain-containing protein  29.82 
 
 
392 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0682623  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0527  HNH endonuclease  46.88 
 
 
365 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.991907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>