20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5252 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5252    100 
 
 		 153 bp  303  7.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1170  transposase IS66  88.71 
 
 		 1524 bp  67.9  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.438673  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2711  transposase IS66  88.71 
 
 		 1521 bp  67.9  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3059  transposase IS66  88.71 
 
 		 1524 bp  67.9  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4451  hypothetical protein  85.9 
 
 		 246 bp  67.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0601744  normal  0.0168193 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2523  transposase IS66  83.91 
 
 		 1554 bp  61.9  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297904  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1401  transposase IS66  83.91 
 
 		 1560 bp  61.9  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1022  transposase IS66  83.91 
 
 		 1560 bp  61.9  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4443  ISPpu14, transposase Orf3  90 
 
 		 1536 bp  60  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.801949  hitchhiker  0.0000589528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5396  ISPpu14, transposase Orf3  90 
 
 		 1536 bp  60  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118381  hitchhiker  0.00957485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59580  putative transposase  84.62 
 
 		 1536 bp  50.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128729  hitchhiker  1.83127e-18 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3687    91.89 
 
 		 246 bp  50.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4016  ISPpu14, transposase Orf3  90 
 
 		 369 bp  48.1  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4650    81.82 
 
 		 681 bp  48.1  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0650  hypothetical protein  88.1 
 
 		 111 bp  44.1  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0572  transposase IS66  80.85 
 
 		 1515 bp  44.1  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0648577 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2455  transposase IS66  80.85 
 
 		 1515 bp  44.1  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2916  transposase IS66  80.85 
 
 		 1515 bp  44.1  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5173  transposase IS66  88.1 
 
 		 1536 bp  44.1  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5956    93.33 
 
 		 147 bp  44.1  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0201554 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>