89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5327 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007950  Bpro_5327  phosphopantetheine-binding  100 
 
 
107 aa  216  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.4619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  43.68 
 
 
2762 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2735  phosphopantetheine-binding  44 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  44.05 
 
 
2103 aa  71.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1647  phosphopantetheine-binding  40 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.546913 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3020  phosphopantetheine-binding  36.9 
 
 
91 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3102  phosphopantetheine-binding  36.9 
 
 
91 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0141016  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2877  phosphopantetheine-binding  44 
 
 
90 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.280459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  37.35 
 
 
1656 aa  63.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0280  polyketide synthase, putative  45.07 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1157  putative polyketide synthase subunit  46.75 
 
 
94 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4741  phosphopantetheine-binding  38.36 
 
 
85 aa  62  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.711261  normal  0.224545 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2785  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  46.75 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2939  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  46.75 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  39.02 
 
 
1474 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1973  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.14 
 
 
544 aa  60.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0027  phosphopantetheine-binding  40 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0175854  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0029  phosphopantetheine-binding  40 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0274  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  33.66 
 
 
106 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  35.53 
 
 
2333 aa  57  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1299  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  33.67 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1711  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  33.67 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1019  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  33.67 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00932782  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0296  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  33.67 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.444896  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  31.13 
 
 
1939 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1797  Acyl carrier protein  33.67 
 
 
96 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01916  hypothetical protein  36.49 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.41353  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5324  beta-ketoacyl synthase  35.9 
 
 
897 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5619  polyketide synthase  35.71 
 
 
93 aa  53.9  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00123968  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4853  Acyl transferase  34.18 
 
 
1819 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  30.11 
 
 
4183 aa  52  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 
662 aa  52  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1219  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  38.57 
 
 
90 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4453  phosphopantetheine-binding protein  39.73 
 
 
101 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  49.02 
 
 
3099 aa  50.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  36.11 
 
 
3337 aa  50.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0180  hypothetical protein  37.14 
 
 
90 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612499  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1669  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  37.14 
 
 
90 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0175  Beta-ketoacyl synthase  32.93 
 
 
1704 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1587  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  37.14 
 
 
90 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.059476  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  32.89 
 
 
506 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11681  polyketide synthase pks17  34.48 
 
 
502 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000530022  normal  0.704924 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2974  6-deoxyerythronolide-B synthase., (Acyl-carrier- protein) S-malonyltransferase  36.84 
 
 
2719 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8815  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  39.39 
 
 
2111 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39915  normal  0.217366 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1430  KR domain protein  28.21 
 
 
5612 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1606  phosphopantetheine-binding  34.29 
 
 
85 aa  47  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.607416 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2455  histidine kinase  26.76 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1024  beta-ketoacyl synthase  35.71 
 
 
2053 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18390  phosphopantetheine-containing protein  31.43 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.674444  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  28.92 
 
 
1876 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0215  Beta-ketoacyl synthase  32.86 
 
 
1759 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6560  acyl carrier protein  30.43 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273089 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  37.14 
 
 
701 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 
1828 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
1823 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 
2367 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1394  putative polyketide synthase PksL  32.56 
 
 
5993 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1906  phosphopantetheine-binding  31.25 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3095  beta-ketoacyl synthase  32.84 
 
 
7157 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2887  Beta-ketoacyl synthase  29.07 
 
 
1208 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5296  Beta-ketoacyl synthase  29.11 
 
 
5802 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0721794 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0168  putative polyketide synthase  35.29 
 
 
5822 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  34.88 
 
 
1820 aa  42.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0860  Beta-ketoacyl synthase  31.03 
 
 
4036 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1479  putative polyketide synthase PksL  35.29 
 
 
5915 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1204  putative polyketide synthase  35.29 
 
 
4212 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1674  polyketide synthase  37.7 
 
 
5628 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  34.78 
 
 
2225 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  38.36 
 
 
991 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0446  putative polyketide synthase  35.29 
 
 
5778 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  35.23 
 
 
2066 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  33.8 
 
 
2162 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  42.65 
 
 
1548 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  35.96 
 
 
4840 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  36.78 
 
 
4151 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5640  beta-ketoacyl synthase  34.33 
 
 
1840 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1169  beta-ketoacyl synthase  34.33 
 
 
1778 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.8 
 
 
2551 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  38.46 
 
 
7149 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1673  thiotemplate mechanism natural product synthetase  35.82 
 
 
3925 aa  41.6  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  32.89 
 
 
1323 aa  41.6  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0862  Beta-ketoacyl synthase  31.4 
 
 
5854 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1130  putative polyketide synthase PksL  36.36 
 
 
2726 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0170  polyketide synthase  36.36 
 
 
2653 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5768  AMP-dependent synthetase and ligase  27.71 
 
 
1292 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  27.71 
 
 
1272 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  39.58 
 
 
1577 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  30.77 
 
 
3424 aa  40.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  36.23 
 
 
3408 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>