30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5257 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007950  Bpro_5257  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  327  3e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1764  hypothetical protein  36.69 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.117494 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6842  dehydratase  38.78 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0206  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.603471  normal  0.590888 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4072  hypothetical protein  31.65 
 
 
153 aa  60.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00371629  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0059  hypothetical protein  31.76 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5537  dehydratase, MaoC-like domain-containing protein  31.94 
 
 
157 aa  57.4  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  35.67 
 
 
683 aa  56.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4847  dehydratase  34.07 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6290  MaoC domain protein dehydratase  36.18 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16324  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3559  hypothetical protein  30.22 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.331876  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2996  hypothetical protein  30.22 
 
 
165 aa  53.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0903588  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3869  MaoC-like dehydratase  30.52 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3292  MaoC-like dehydratase  28.99 
 
 
158 aa  52  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6312  MaoC domain protein dehydratase  35.82 
 
 
157 aa  50.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2956  MaoC domain protein dehydratase  30.83 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7289  MaoC-like dehydratase  32.43 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0232  dehydratase  28.95 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  30.46 
 
 
679 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  31.29 
 
 
695 aa  43.9  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2751  MaoC domain protein dehydratase  30.47 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84456  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2898  MaoC domain protein dehydratase  31.86 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  30.46 
 
 
690 aa  43.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1037  dehydratase  26.81 
 
 
163 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4212  MaoC domain protein dehydratase  23.24 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4088  hypothetical protein  29.63 
 
 
166 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977948  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2124  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
144 aa  42.4  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000215155  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2642  MaoC-like dehydratase  31.08 
 
 
153 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0612  MaoC domain protein dehydratase  29.5 
 
 
166 aa  41.6  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1191  MaoC-like dehydratase  26.24 
 
 
149 aa  41.2  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>