19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5336 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007950  Bpro_5336  hypothetical protein  100 
 
 
534 aa  1088    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.818376  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0287  hypothetical protein  37.33 
 
 
486 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.753964 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1608  hypothetical protein  38.52 
 
 
495 aa  281  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0349  hypothetical protein  34.7 
 
 
493 aa  242  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1827  hypothetical protein  31.5 
 
 
488 aa  215  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.698781  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1510  hypothetical protein  29.47 
 
 
492 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0012  hypothetical protein  30.29 
 
 
493 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140441  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0421  hypothetical protein  32.09 
 
 
493 aa  194  4e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.805168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0279  hypothetical protein  31.9 
 
 
491 aa  187  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1150  hypothetical protein  32.7 
 
 
491 aa  183  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2046  hypothetical protein  30.12 
 
 
525 aa  180  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0241  hypothetical protein  30.6 
 
 
496 aa  179  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0951  hypothetical protein  29.53 
 
 
492 aa  179  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0950  phosphomethylpyrimidine kinase  30.57 
 
 
451 aa  166  9e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.28036  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3050  hypothetical protein  25.29 
 
 
500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.337959  normal  0.021691 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl410  hypothetical protein  27.83 
 
 
709 aa  81.6  0.00000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0521  hypothetical protein  26.24 
 
 
714 aa  73.9  0.000000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2366  hypothetical protein  28.74 
 
 
663 aa  60.8  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0164  hypothetical protein  20.37 
 
 
690 aa  47  0.0008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>