19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3050 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3050  hypothetical protein  100 
 
 
500 aa  1048    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.337959  normal  0.021691 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0279  hypothetical protein  51.88 
 
 
491 aa  530  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0012  hypothetical protein  50.51 
 
 
493 aa  518  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140441  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0951  hypothetical protein  41.48 
 
 
492 aa  358  9.999999999999999e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0241  hypothetical protein  40.7 
 
 
496 aa  356  5.999999999999999e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0950  phosphomethylpyrimidine kinase  38.93 
 
 
451 aa  311  2e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.28036  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1510  hypothetical protein  36.27 
 
 
492 aa  294  3e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0349  hypothetical protein  33.2 
 
 
493 aa  274  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0287  hypothetical protein  32.99 
 
 
486 aa  263  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.753964 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1150  hypothetical protein  31.15 
 
 
491 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1608  hypothetical protein  33.62 
 
 
495 aa  238  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0421  hypothetical protein  33.4 
 
 
493 aa  237  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.805168  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1827  hypothetical protein  28.14 
 
 
488 aa  140  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.698781  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5336  hypothetical protein  24.77 
 
 
534 aa  140  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.818376  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2046  hypothetical protein  25.51 
 
 
525 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0521  hypothetical protein  32.17 
 
 
714 aa  108  2e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl410  hypothetical protein  30.99 
 
 
709 aa  89  2e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2366  hypothetical protein  26.39 
 
 
663 aa  65.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0164  hypothetical protein  24.78 
 
 
690 aa  48.9  0.0002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>