19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0287 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0287  hypothetical protein  100 
 
 		 486 aa  1000    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.753964 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1608  hypothetical protein  46.46 
 
 		 495 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0349  hypothetical protein  43.71 
 
 		 493 aa  391  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1827  hypothetical protein  35.04 
 
 		 488 aa  299  7e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.698781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0012  hypothetical protein  36.25 
 
 		 493 aa  296  4e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140441  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1150  hypothetical protein  35.2 
 
 		 491 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0421  hypothetical protein  37.89 
 
 		 493 aa  286  8e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.805168  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5336  hypothetical protein  37.33 
 
 		 534 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.818376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0951  hypothetical protein  34.96 
 
 		 492 aa  268  1e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3050  hypothetical protein  32.99 
 
 		 500 aa  263  4e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.337959  normal  0.021691 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0279  hypothetical protein  34.44 
 
 		 491 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0241  hypothetical protein  32.64 
 
 		 496 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1510  hypothetical protein  33.26 
 
 		 492 aa  253  5.000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2046  hypothetical protein  37.92 
 
 		 525 aa  241  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0950  phosphomethylpyrimidine kinase  30.34 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.28036  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl410  hypothetical protein  31.86 
 
 		 709 aa  107  7e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2366  hypothetical protein  23.92 
 
 		 663 aa  99.4  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0521  hypothetical protein  28.7 
 
 		 714 aa  95.9  2e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0164  hypothetical protein  28.19 
 
 		 690 aa  72  0.00000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>