19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0241 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0241  hypothetical protein  100 
 
 
496 aa  1034    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3050  hypothetical protein  40.7 
 
 
500 aa  356  5.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.337959  normal  0.021691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0012  hypothetical protein  41.8 
 
 
493 aa  352  8e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0279  hypothetical protein  39.51 
 
 
491 aa  345  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1510  hypothetical protein  36.63 
 
 
492 aa  336  5e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0421  hypothetical protein  37.65 
 
 
493 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.805168  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1150  hypothetical protein  37.5 
 
 
491 aa  287  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0951  hypothetical protein  36.69 
 
 
492 aa  281  2e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0349  hypothetical protein  33.47 
 
 
493 aa  266  8.999999999999999e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0287  hypothetical protein  32.64 
 
 
486 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.753964 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0950  phosphomethylpyrimidine kinase  34.96 
 
 
451 aa  255  2.0000000000000002e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.28036  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1608  hypothetical protein  34.59 
 
 
495 aa  239  9e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1827  hypothetical protein  28.37 
 
 
488 aa  179  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.698781  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5336  hypothetical protein  30.33 
 
 
534 aa  177  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.818376  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2046  hypothetical protein  29.15 
 
 
525 aa  143  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl410  hypothetical protein  32.8 
 
 
709 aa  109  1e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0521  hypothetical protein  28.03 
 
 
714 aa  103  9e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2366  hypothetical protein  26.79 
 
 
663 aa  62.4  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0164  hypothetical protein  24.5 
 
 
690 aa  59.3  0.0000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>