19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0279 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0279  hypothetical protein  100 
 
 		 491 aa  1011    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3050  hypothetical protein  51.88 
 
 		 500 aa  530  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.337959  normal  0.021691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0012  hypothetical protein  48.06 
 
 		 493 aa  476  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140441  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0951  hypothetical protein  42.36 
 
 		 492 aa  369  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0241  hypothetical protein  39.51 
 
 		 496 aa  345  1e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0950  phosphomethylpyrimidine kinase  40.58 
 
 		 451 aa  345  1e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.28036  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1510  hypothetical protein  35.05 
 
 		 492 aa  282  1e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0349  hypothetical protein  36.34 
 
 		 493 aa  269  8e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0421  hypothetical protein  34.98 
 
 		 493 aa  259  9e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.805168  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0287  hypothetical protein  34.44 
 
 		 486 aa  258  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.753964 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1150  hypothetical protein  33.81 
 
 		 491 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1608  hypothetical protein  34.3 
 
 		 495 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5336  hypothetical protein  30.94 
 
 		 534 aa  182  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.818376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1827  hypothetical protein  29.64 
 
 		 488 aa  175  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.698781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2046  hypothetical protein  28.06 
 
 		 525 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0521  hypothetical protein  31.68 
 
 		 714 aa  125  1e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl410  hypothetical protein  29.37 
 
 		 709 aa  107  4e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2366  hypothetical protein  24.86 
 
 		 663 aa  92.4  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0164  hypothetical protein  25 
 
 		 690 aa  50.4  0.00007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>