19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1608 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1608  hypothetical protein  100 
 
 		 495 aa  1006    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0287  hypothetical protein  46.46 
 
 		 486 aa  450  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.753964 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0349  hypothetical protein  44.82 
 
 		 493 aa  371  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1827  hypothetical protein  39.87 
 
 		 488 aa  321  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.698781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0421  hypothetical protein  39.83 
 
 		 493 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.805168  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1150  hypothetical protein  38.61 
 
 		 491 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5336  hypothetical protein  38.32 
 
 		 534 aa  272  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.818376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0012  hypothetical protein  34.04 
 
 		 493 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140441  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2046  hypothetical protein  39.38 
 
 		 525 aa  260  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0951  hypothetical protein  36.06 
 
 		 492 aa  259  6e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0241  hypothetical protein  34.59 
 
 		 496 aa  242  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0279  hypothetical protein  34.3 
 
 		 491 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3050  hypothetical protein  33.62 
 
 		 500 aa  239  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.337959  normal  0.021691 
 
 
-
 
NC_002936  DET1510  hypothetical protein  32.49 
 
 		 492 aa  225  2e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0950  phosphomethylpyrimidine kinase  31.08 
 
 		 451 aa  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.28036  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl410  hypothetical protein  35.19 
 
 		 709 aa  110  6e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0521  hypothetical protein  25.53 
 
 		 714 aa  102  1e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2366  hypothetical protein  30.11 
 
 		 663 aa  62.4  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0164  hypothetical protein  24.36 
 
 		 690 aa  60.1  0.00000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>