17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2046 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2046  hypothetical protein  100 
 
 
525 aa  1039    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1608  hypothetical protein  38.02 
 
 
495 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0287  hypothetical protein  37.34 
 
 
486 aa  254  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.753964 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1827  hypothetical protein  32.38 
 
 
488 aa  223  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.698781  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0349  hypothetical protein  33.71 
 
 
493 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5336  hypothetical protein  30.32 
 
 
534 aa  172  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.818376  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0421  hypothetical protein  31.81 
 
 
493 aa  157  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.805168  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0241  hypothetical protein  27.92 
 
 
496 aa  148  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1510  hypothetical protein  26.43 
 
 
492 aa  145  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0012  hypothetical protein  26.01 
 
 
493 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0279  hypothetical protein  27.96 
 
 
491 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1150  hypothetical protein  28.93 
 
 
491 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3050  hypothetical protein  26.02 
 
 
500 aa  139  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.337959  normal  0.021691 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0951  hypothetical protein  27.32 
 
 
492 aa  133  7.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0950  phosphomethylpyrimidine kinase  25.48 
 
 
451 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.28036  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0521  hypothetical protein  27.57 
 
 
714 aa  72.8  0.00000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl410  hypothetical protein  24.43 
 
 
709 aa  67  0.0000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>