21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1827 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1827  hypothetical protein  100 
 
 		 488 aa  1008    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.698781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1608  hypothetical protein  39.87 
 
 		 495 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0287  hypothetical protein  35.04 
 
 		 486 aa  299  7e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.753964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2046  hypothetical protein  32.23 
 
 		 525 aa  209  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0421  hypothetical protein  31.22 
 
 		 493 aa  206  6e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.805168  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5336  hypothetical protein  30.71 
 
 		 534 aa  206  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.818376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0349  hypothetical protein  28.86 
 
 		 493 aa  191  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0012  hypothetical protein  29.8 
 
 		 493 aa  189  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140441  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1150  hypothetical protein  29.82 
 
 		 491 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1510  hypothetical protein  29.58 
 
 		 492 aa  180  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0241  hypothetical protein  28.37 
 
 		 496 aa  179  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0279  hypothetical protein  29.64 
 
 		 491 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0951  hypothetical protein  28.57 
 
 		 492 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0950  phosphomethylpyrimidine kinase  30.1 
 
 		 451 aa  164  4.0000000000000004e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.28036  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3050  hypothetical protein  28.14 
 
 		 500 aa  140  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.337959  normal  0.021691 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0521  hypothetical protein  30.97 
 
 		 714 aa  97.1  6e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl410  hypothetical protein  29.73 
 
 		 709 aa  95.1  3e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0164  hypothetical protein  23.05 
 
 		 690 aa  63.9  0.000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2366  hypothetical protein  22.94 
 
 		 663 aa  54.3  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0818  RecB family-like nuclease  24.03 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0841  RecB family-like nuclease  24.03 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>