More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2574 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2574  hypothetical protein  100 
 
 
420 aa  859    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2428  hypothetical protein  99.05 
 
 
420 aa  856    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0165  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.74 
 
 
826 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2659  hypothetical protein  31.72 
 
 
429 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0018  seriplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 
409 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2790  hypothetical protein  31.72 
 
 
429 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6245  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.79 
 
 
857 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2006  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.25 
 
 
852 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000507491  normal  0.0782006 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0927  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.81 
 
 
704 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0769186  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1957  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.1 
 
 
851 aa  167  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1801  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.23 
 
 
699 aa  164  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000631548  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0484  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.36 
 
 
847 aa  163  6e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06089  transmembrane sensor histidine kinase  25.94 
 
 
681 aa  162  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0924  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.05 
 
 
701 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0455  sensor histidine kinase/response regulator LuxN  26.51 
 
 
686 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5059  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.25 
 
 
841 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000289  sensor histidine kinase CqsS  24.82 
 
 
681 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.487379  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4754  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.13 
 
 
852 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16465  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2193  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.87 
 
 
716 aa  145  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14825  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0885  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.31 
 
 
697 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2923  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  25.82 
 
 
410 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.950573 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  0.649992 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4042  histidine kinase  30 
 
 
461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601424  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0671  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.4 
 
 
857 aa  127  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269812 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3506  ATP-binding region, ATPase-like  28.33 
 
 
496 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0457672  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05203  two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  30 
 
 
461 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0394987  normal  0.0112976 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7077  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 
480 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1157  autoinducer regulatory protein AinR  31.44 
 
 
822 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5020  histidine kinase  25.37 
 
 
420 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871179  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
485 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195097  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02766  histidine kinase  30.46 
 
 
849 aa  104  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 
480 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3513  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.92 
 
 
425 aa  103  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.600596  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003077  autoinducer 1 sensor kinase/phosphatase luxN  28.23 
 
 
846 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 
434 aa  90.9  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2531  sensory box histidine kinase  28.03 
 
 
1053 aa  90.5  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.606569  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0189  histidine kinase  30 
 
 
598 aa  89  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.602586 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0449  hypothetical protein  26.42 
 
 
1126 aa  87.8  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.812136 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1040  hypothetical protein  26.51 
 
 
643 aa  88.2  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4825  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.21 
 
 
582 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  27.45 
 
 
446 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0051  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 
651 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2297  sensor histidine kinase  26.79 
 
 
471 aa  84.7  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.40496  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 
622 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157895  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4371  histidine kinase  28.07 
 
 
589 aa  84  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.948741 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 
680 aa  83.6  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0437  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 
412 aa  83.6  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.148474  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0088  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0292  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.59 
 
 
393 aa  83.2  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.183452  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 
648 aa  82.8  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0906  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 
528 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 
671 aa  82.4  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3284  histidine kinase  28.05 
 
 
625 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2599  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 
450 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0620227 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3060  ATPase domain-containing protein  27.52 
 
 
625 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457203  normal  0.839364 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0184  sensor protein PilS, putative  25.73 
 
 
530 aa  81.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0363  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.73 
 
 
530 aa  81.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.63729 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2848  histidine kinase  22.38 
 
 
481 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0675  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 
855 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 
932 aa  80.1  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0249  histidine kinase  26.12 
 
 
459 aa  80.1  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 
446 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.93 
 
 
465 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0053  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 
444 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 
439 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  26.72 
 
 
594 aa  79.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.66 
 
 
975 aa  79.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.69 
 
 
416 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.465456  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2563  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 
543 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5020  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 
474 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323054  normal  0.120297 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3005  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 
443 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4040  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 
443 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.45469 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4977  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 
443 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.870976  normal  0.849775 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2031  sensor histidine kinase  25 
 
 
435 aa  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.465234  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2379  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 
538 aa  78.2  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
435 aa  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 
581 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00493244  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.11 
 
 
1127 aa  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1299  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
618 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000225639 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.45 
 
 
526 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
1171 aa  77  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  24.66 
 
 
439 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0692  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.640091 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.87 
 
 
877 aa  77.4  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 
553 aa  76.6  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0197  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 
907 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262626  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.88 
 
 
968 aa  76.6  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3236  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 
900 aa  76.3  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.734401  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0307  aerobic respiration control sensor protein ArcB  28 
 
 
789 aa  76.3  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0739851  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 
408 aa  75.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  25.9 
 
 
438 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 
978 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0301  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.88 
 
 
789 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0737861  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  29.66 
 
 
482 aa  75.5  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  25.9 
 
 
438 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  25.9 
 
 
438 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  25.9 
 
 
438 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  25.9 
 
 
438 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0372  histidine kinase  26.27 
 
 
505 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60250  two-component sensor PilS  25.86 
 
 
530 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000371089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>