More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0194 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0194  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 321 aa  645    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0170  preprotein translocase subunit SecF  99.69 
 
 		 321 aa  644    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00521  preprotein translocase subunit SecF  77.33 
 
 		 322 aa  494  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1618  preprotein translocase subunit SecF  71.78 
 
 		 326 aa  462  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00379404  normal  0.63371 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  39.75 
 
 		 312 aa  222  7e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  39.3 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  40.06 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  37.86 
 
 		 323 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  41.83 
 
 		 303 aa  208  9e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  41.83 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  40.74 
 
 		 337 aa  206  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  40.74 
 
 		 316 aa  206  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  36.74 
 
 		 315 aa  205  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  38.22 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  37.7 
 
 		 305 aa  202  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  39.53 
 
 		 315 aa  202  7e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  38.92 
 
 		 315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  35.6 
 
 		 323 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  35.6 
 
 		 323 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  35.6 
 
 		 323 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  37.62 
 
 		 315 aa  200  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  35.6 
 
 		 323 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  35.6 
 
 		 323 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  36.6 
 
 		 323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  36.6 
 
 		 323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  36.6 
 
 		 323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  36.6 
 
 		 323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  36.6 
 
 		 323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  36.6 
 
 		 323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  36.6 
 
 		 323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  36.6 
 
 		 323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  36.6 
 
 		 323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  34.5 
 
 		 315 aa  199  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  34.95 
 
 		 322 aa  199  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  40 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  38.21 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4618  preprotein translocase subunit SecF  40.58 
 
 		 304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  38.24 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  38.24 
 
 		 315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  38.24 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  39.09 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  34.19 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1573  preprotein translocase subunit SecF  38.24 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00583403  hitchhiker  0.000000100837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  38.64 
 
 		 302 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  38.96 
 
 		 302 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0684  preprotein translocase subunit SecF  35.92 
 
 		 309 aa  195  7e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.738953  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3288  preprotein translocase subunit SecF  37.7 
 
 		 322 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  38.17 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  35.1 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  38.24 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  36.45 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2903  preprotein translocase subunit SecF  38.93 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40450  preprotein translocase subunit SecF  38.31 
 
 		 304 aa  192  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.193489  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3261  preprotein translocase subunit SecF  37.14 
 
 		 322 aa  192  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.578435  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3120  preprotein translocase subunit SecF  37.14 
 
 		 322 aa  192  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0405125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3381  preprotein translocase subunit SecF  37.14 
 
 		 322 aa  192  6e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144101  normal  0.396634 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  35.96 
 
 		 313 aa  192  7e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  40 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  36.48 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  36.6 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  39.68 
 
 		 315 aa  190  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1450  preprotein translocase subunit SecF  37.66 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1022  preprotein translocase subunit SecF  38.21 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  34.38 
 
 		 314 aa  189  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2190  preprotein translocase subunit SecF  38.96 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.447622  decreased coverage  0.00319916 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  35.74 
 
 		 315 aa  189  7e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1385  preprotein translocase subunit SecF  37.34 
 
 		 315 aa  188  9e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00983524  hitchhiker  0.000000302266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1438  preprotein translocase subunit SecF  37.34 
 
 		 315 aa  188  9e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107161  hitchhiker  0.00000672809 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  36.77 
 
 		 314 aa  187  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.37 
 
 		 839 aa  186  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.56 
 
 		 856 aa  185  8e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  36.81 
 
 		 338 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1293  preprotein translocase subunit SecF  39.16 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  33.79 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  34.8 
 
 		 313 aa  183  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  33.11 
 
 		 301 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3517  preprotein translocase subunit SecF  36.45 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.943932  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1312  preprotein translocase subunit SecF  34.27 
 
 		 313 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14650  preprotein translocase subunit SecF  39.16 
 
 		 306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  34.95 
 
 		 357 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1759  preprotein translocase subunit SecF  37.46 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.020465  normal  0.0122623 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0600  protein-export membrane protein SecF  34.64 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  35.07 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.27 
 
 		 844 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.24 
 
 		 844 aa  179  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2775  preprotein translocase subunit SecF  35.74 
 
 		 334 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  33.66 
 
 		 311 aa  180  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2776  preprotein translocase subunit SecF  35.78 
 
 		 369 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.686561  normal  0.719321 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2080  preprotein translocase subunit SecF  35.84 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  35.25 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2889  preprotein translocase subunit SecF  36.48 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000629469 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.25 
 
 		 845 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  33.66 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  36.36 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0837  preprotein translocase subunit SecF  33.89 
 
 		 316 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1509  preprotein translocase subunit SecF  33.67 
 
 		 324 aa  177  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.444089 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0702  preprotein translocase subunit SecF  34.71 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.686375  normal  0.807805 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0345  preprotein translocase subunit SecF  33.02 
 
 		 344 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105677 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2731  preprotein translocase subunit SecF  36.86 
 
 		 367 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.258523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2528  preprotein translocase subunit SecF  35.55 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>