More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2657 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2657  Oxidoreductase domain protein  100 
 
 
500 aa  1003    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0282039  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  64.85 
 
 
493 aa  566  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  58.19 
 
 
470 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  58.84 
 
 
495 aa  507  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  58.67 
 
 
450 aa  464  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  55.95 
 
 
474 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  55.73 
 
 
467 aa  423  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  45.35 
 
 
431 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  45.19 
 
 
431 aa  391  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  47.33 
 
 
435 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  48.04 
 
 
452 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  44.39 
 
 
427 aa  357  2.9999999999999997e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  43.28 
 
 
444 aa  345  1e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  42.7 
 
 
455 aa  342  7e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  43.07 
 
 
496 aa  328  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  38.39 
 
 
442 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  40.53 
 
 
429 aa  281  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  39.51 
 
 
425 aa  279  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  38.34 
 
 
421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  39.29 
 
 
425 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5530  oxidoreductase domain protein  43.5 
 
 
411 aa  272  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  33.95 
 
 
427 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  30.83 
 
 
393 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 
385 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  26.54 
 
 
385 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  29.87 
 
 
390 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  26.06 
 
 
386 aa  99  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  29.86 
 
 
396 aa  98.2  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  34 
 
 
397 aa  97.4  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  29.8 
 
 
699 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  29.39 
 
 
390 aa  95.9  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 
390 aa  90.1  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  23.42 
 
 
403 aa  89.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  27.42 
 
 
399 aa  88.2  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  24.61 
 
 
393 aa  87.8  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4990  oxidoreductase domain-containing protein  27.6 
 
 
414 aa  84  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  28.77 
 
 
330 aa  84  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  23.11 
 
 
404 aa  83.2  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0431  oxidoreductase domain protein  21.43 
 
 
416 aa  81.6  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  28.77 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  29.6 
 
 
347 aa  80.1  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  32.89 
 
 
405 aa  79  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  28.65 
 
 
403 aa  79  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  34.46 
 
 
331 aa  79.3  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  22.02 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  30.93 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  25.82 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 
405 aa  77  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  24.51 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  27.15 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0615  oxidoreductase domain-containing protein  24.1 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652806  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 
405 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  30.87 
 
 
317 aa  75.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  23.93 
 
 
421 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  31.61 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  23.64 
 
 
421 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  28.19 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  33.33 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  23.64 
 
 
421 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  30.45 
 
 
335 aa  73.6  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  24.53 
 
 
388 aa  73.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.56 
 
 
330 aa  72.8  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.31 
 
 
329 aa  72.4  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  26.44 
 
 
371 aa  72.8  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  25.5 
 
 
405 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 
375 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  22.13 
 
 
371 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1950  oxidoreductase domain-containing protein  27.54 
 
 
380 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  28.95 
 
 
329 aa  72  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  31.54 
 
 
334 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  33.74 
 
 
337 aa  72.4  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  26.33 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4191  oxidoreductase domain protein  26.33 
 
 
425 aa  71.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2166  oxidoreductase domain protein  26.47 
 
 
440 aa  71.6  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.81218  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  31.91 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  31.65 
 
 
380 aa  72  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0613  oxidoreductase domain protein  26.97 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.43 
 
 
366 aa  70.9  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  24.58 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 
458 aa  70.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  22.93 
 
 
370 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  30.34 
 
 
435 aa  70.5  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  28.1 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  34.5 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  35.62 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01870  streptomycin biosynthesis protein StrI, putative  26.92 
 
 
478 aa  70.1  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  30.17 
 
 
333 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  34.81 
 
 
349 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1110  oxidoreductase-like protein  25.94 
 
 
400 aa  69.7  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00265336  hitchhiker  0.0048453 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  26.7 
 
 
360 aa  69.7  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1396  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
364 aa  69.7  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1243  putative oxidoreductase YjhC  30.13 
 
 
367 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.281927 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  26.7 
 
 
360 aa  69.7  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  32.62 
 
 
334 aa  69.7  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  29.14 
 
 
333 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3835  inositol 2-dehydrogenase  30 
 
 
334 aa  69.7  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  22.93 
 
 
370 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>