More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1953 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 275 aa  546  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  38.89 
 
 		 218 aa  142  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  31.85 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  32.94 
 
 		 641 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  36.79 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  30.26 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  39.11 
 
 		 606 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  38.56 
 
 		 610 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  31.31 
 
 		 592 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  31.35 
 
 		 593 aa  112  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  36.71 
 
 		 602 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  43.09 
 
 		 226 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  28.85 
 
 		 589 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  40.43 
 
 		 587 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  34.67 
 
 		 578 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  29.6 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1138  hypothetical protein  31.88 
 
 		 270 aa  99.8  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1875  hypothetical protein  31.8 
 
 		 212 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  31.25 
 
 		 652 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  34.04 
 
 		 247 aa  97.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  31.43 
 
 		 574 aa  92.8  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2555  hypothetical protein  31.13 
 
 		 273 aa  92  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216389 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  34.29 
 
 		 589 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  25.42 
 
 		 615 aa  88.2  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  30.43 
 
 		 605 aa  87.4  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  31.09 
 
 		 595 aa  87  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  29.29 
 
 		 565 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  34.83 
 
 		 599 aa  82.4  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  31.78 
 
 		 602 aa  81.3  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  27.84 
 
 		 594 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  31.06 
 
 		 616 aa  79.7  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1026  vgrG protein  30.29 
 
 		 1095 aa  79.3  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  24.23 
 
 		 617 aa  79  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0115  vgrG protein  28.63 
 
 		 694 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  25.74 
 
 		 598 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  25.39 
 
 		 618 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  27.27 
 
 		 589 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  26.97 
 
 		 596 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  26.84 
 
 		 589 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  26.58 
 
 		 596 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  31.01 
 
 		 743 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  25.55 
 
 		 581 aa  73.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  32.95 
 
 		 697 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  27.59 
 
 		 794 aa  72.4  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  33.05 
 
 		 730 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  33.05 
 
 		 729 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  26.78 
 
 		 754 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  33.05 
 
 		 729 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  26.41 
 
 		 596 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  27.82 
 
 		 727 aa  72  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  28.29 
 
 		 576 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  31.54 
 
 		 847 aa  71.2  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  25.09 
 
 		 687 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  27.04 
 
 		 642 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  30.17 
 
 		 669 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  33.62 
 
 		 610 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  26.6 
 
 		 754 aa  69.7  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  26.12 
 
 		 706 aa  69.7  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  26.71 
 
 		 602 aa  69.7  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  30.29 
 
 		 668 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  30.83 
 
 		 771 aa  69.7  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  29.52 
 
 		 661 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  29.92 
 
 		 714 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  33.05 
 
 		 712 aa  69.3  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  26.81 
 
 		 1017 aa  69.3  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  27.31 
 
 		 697 aa  69.3  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3558  type VI secretion system Vgr family protein  27.03 
 
 		 782 aa  68.9  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125148  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  29.58 
 
 		 668 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  33.05 
 
 		 775 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3429  Rhs element Vgr protein  26.42 
 
 		 782 aa  68.9  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  33.05 
 
 		 775 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02038  Rhs element Vgr protein  29.53 
 
 		 477 aa  68.9  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.307189  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1538  two component LuxR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 621 aa  68.9  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  33.05 
 
 		 775 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  33.05 
 
 		 775 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  27.46 
 
 		 687 aa  68.9  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  27.46 
 
 		 687 aa  68.9  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  27.46 
 
 		 687 aa  68.9  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000029  hypothetical protein  23.83 
 
 		 611 aa  68.9  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0394  Rhs element Vgr protein  50 
 
 		 811 aa  68.9  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  33.05 
 
 		 775 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  28.92 
 
 		 661 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  33.05 
 
 		 775 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  33.05 
 
 		 775 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  30.53 
 
 		 741 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  30.53 
 
 		 741 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  50 
 
 		 1094 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  30.82 
 
 		 872 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  34.45 
 
 		 780 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0043  Rhs element Vgr protein  28.04 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  31.75 
 
 		 703 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02036  Rhs element Vgr protein  29.53 
 
 		 587 aa  68.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372394  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2959  hypothetical protein  26.09 
 
 		 644 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  31.51 
 
 		 896 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  34.48 
 
 		 617 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  34.48 
 
 		 617 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  31.51 
 
 		 858 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  37.93 
 
 		 901 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  31.51 
 
 		 930 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  26.8 
 
 		 645 aa  67.4  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>