More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1589 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1589  ABC transporter related protein  100 
 
 		 230 aa  456  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11191  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3176  ABC transporter related protein  87.91 
 
 		 218 aa  354  5e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1582  ABC transporter related protein  77.78 
 
 		 240 aa  337  9.999999999999999e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217269  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0852  ABC transporter related protein  75.8 
 
 		 240 aa  336  1.9999999999999998e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21600  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  57.07 
 
 		 214 aa  219  3.9999999999999997e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  53.11 
 
 		 221 aa  207  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.31196  normal  0.583973 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0083  ABC transporter related  46.86 
 
 		 212 aa  180  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.599688 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  43.06 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  43.32 
 
 		 288 aa  166  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0225  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.34 
 
 		 235 aa  166  4e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.09 
 
 		 230 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  40.83 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  45.13 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  38.05 
 
 		 227 aa  163  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  41.52 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.08 
 
 		 238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27880  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.27 
 
 		 235 aa  161  9e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  41.04 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2963  ABC transporter related  43.46 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665747 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  38.81 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  41.89 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0584  ABC transporter related protein  43.06 
 
 		 227 aa  159  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.378842  normal  0.517504 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  42.79 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2822  ABC transporter related protein  45.58 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.794487  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4388  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.26 
 
 		 238 aa  159  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119739  normal  0.0787869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  42.56 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2195  ABC transporter related  45.13 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0336091  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  41.18 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6782  ABC transporter related  48.97 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  43.61 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.18 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.57 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.57 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.57 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1835  ABC transporter-related protein  47.76 
 
 		 227 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0817226  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.57 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.57 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2202  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.1 
 
 		 227 aa  159  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3274  ABC transporter related  43.94 
 
 		 232 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991934  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.67 
 
 		 233 aa  158  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1920  ABC transporter related  47.76 
 
 		 227 aa  158  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0842487  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  41.58 
 
 		 233 aa  158  7e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.58 
 
 		 233 aa  158  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.89 
 
 		 225 aa  158  7e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  41.58 
 
 		 233 aa  158  7e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  40.41 
 
 		 225 aa  158  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  45 
 
 		 229 aa  158  8e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  38.36 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4410  ABC transporter related  46.7 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1250  putative ATP-binding component of a transport system  44.06 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.40949e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2599  ABC transporter related  43.14 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.215852  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0642  ABC transporter related  43.88 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.63 
 
 		 647 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7925  ABC transporter related  48.96 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3157  ABC transporter related protein  44.88 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0483  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  43.88 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.09 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.09 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4330  ABC transporter related protein  46.12 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2043  ABC transporter, ATPase subunit  48.69 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.062878  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.09 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  42.5 
 
 		 408 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  38.81 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.66 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.09 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  38.35 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1863  ABC transporter, ATPase subunit  44.1 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0577867  normal  0.0321889 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.81 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  42.93 
 
 		 249 aa  155  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  41.7 
 
 		 251 aa  155  4e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3761  ABC transporter related protein  44.33 
 
 		 265 aa  155  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1377  ABC transporter related  48.73 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.757456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.93 
 
 		 236 aa  155  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2863  ABC transporter related  41.67 
 
 		 232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.479401  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0678  ABC transporter, ATP-binding protein  41.07 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.586556  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.09 
 
 		 233 aa  155  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1173  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.4 
 
 		 230 aa  155  6e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.659944  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02440  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.34 
 
 		 227 aa  155  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1339  ATPase  42.44 
 
 		 232 aa  155  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15650  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.23 
 
 		 244 aa  154  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1839  ABC transporter related  40.55 
 
 		 220 aa  154  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.82 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0776  ABC lipoprotein efflux transporter, ATPase subunit, LolD  45.37 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000167  predicted ABC-type transport system ATPase component  45.13 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.780039  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.09 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3203  ABC transporter related  42.01 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1004  ABC transporter related  45.64 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.664588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  40.64 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  40.09 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  41.54 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  42.65 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  39.69 
 
 		 226 aa  154  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.51 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0748  ABC transporter related  43.81 
 
 		 227 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.51 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  42.05 
 
 		 687 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1795  ABC transporter related  43.59 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.219829  normal  0.943815 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  39.22 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  38.24 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  40 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>