71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1179 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1179  Peptidase M23  100 
 
 
193 aa  366  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.949137  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1314  peptidase M23B  51.75 
 
 
164 aa  117  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1203  peptidase M23B  49.65 
 
 
214 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1003  Peptidase M23  39.89 
 
 
170 aa  112  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.760596  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1366  peptidase M23B  43.8 
 
 
173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0643294  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2508  Peptidase M23  47.86 
 
 
191 aa  104  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.326949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1412  peptidase M23B  51.39 
 
 
177 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3992  Peptidase M23  46.81 
 
 
175 aa  102  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10110  metalloendopeptidase-like membrane protein  45.77 
 
 
238 aa  100  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1383  Peptidase M23  46.38 
 
 
193 aa  99.8  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000013113 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1483  Peptidase M23  43.21 
 
 
203 aa  98.6  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.22964  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2103  Peptidase M23  41.45 
 
 
174 aa  97.1  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29214  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09880  metalloendopeptidase-like membrane protein  40 
 
 
219 aa  96.3  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1528  Peptidase M23  41.38 
 
 
139 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0244521 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1543  peptidase M23B  41.01 
 
 
254 aa  93.2  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1992  peptidase M23B  45 
 
 
161 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2038  peptidase M23B  45 
 
 
161 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101119  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1973  peptidase M23B  45 
 
 
161 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2208  peptidase M23B  44.7 
 
 
162 aa  92  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3244  peptidase M23B  46.81 
 
 
211 aa  89.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.6882  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4134  peptidase M23B  42.42 
 
 
162 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300034  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0396  M23/M37 family membrane peptidase  36.2 
 
 
195 aa  88.6  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00347919  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1160  peptidase M23B  40 
 
 
269 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0988  Peptidase M23  42.34 
 
 
174 aa  86.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  0.110335 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12905  hypothetical protein  41.79 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00765288  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3582  peptidase M23B  42.06 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1657  Peptidase M23  39.86 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0950  peptidase, M23 family  35.42 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0675  hypothetical protein  47.06 
 
 
362 aa  81.6  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3114  Peptidase M23  44.6 
 
 
170 aa  80.9  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153698  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1859  peptidase, M23/M37 family  40.52 
 
 
223 aa  78.2  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.986198  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11180  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.97 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00950153  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5912  Peptidase M23  36.67 
 
 
331 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00345275  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  24.46 
 
 
395 aa  49.7  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2441  Peptidase M23  26.85 
 
 
735 aa  48.9  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00201295  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  30.37 
 
 
509 aa  48.5  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  25 
 
 
307 aa  46.6  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  31.62 
 
 
265 aa  47  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03518  hypothetical protein  25 
 
 
307 aa  45.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0307  Peptidase M23  36.36 
 
 
298 aa  45.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000988851  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  27.59 
 
 
262 aa  45.4  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  23.94 
 
 
289 aa  45.1  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  29.2 
 
 
445 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  22.93 
 
 
290 aa  43.9  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  23.33 
 
 
374 aa  43.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  24.67 
 
 
377 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  24.67 
 
 
377 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  24.67 
 
 
377 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  24.67 
 
 
377 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  24.67 
 
 
377 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  27.21 
 
 
468 aa  42.4  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1059  peptidase M23B  25.75 
 
 
309 aa  42.4  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2699  peptidase M23  28.36 
 
 
500 aa  42.4  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349979  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  24.48 
 
 
310 aa  42.4  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  25.68 
 
 
316 aa  42  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  36.17 
 
 
610 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0840  Peptidase M23  23.88 
 
 
404 aa  41.6  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250204  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1779  Peptidase M23  30 
 
 
354 aa  41.6  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1192  peptidase M23B  23.78 
 
 
296 aa  41.6  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0061  lipoprotein NlpD  23.47 
 
 
311 aa  41.6  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  25.37 
 
 
417 aa  41.2  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  34.91 
 
 
266 aa  41.2  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  23.13 
 
 
379 aa  41.2  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0946  Peptidase M23  23.13 
 
 
379 aa  41.2  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0564272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  23.13 
 
 
379 aa  41.2  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  23.13 
 
 
379 aa  41.2  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2867  lipoprotein NlpD  23.13 
 
 
379 aa  41.2  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  23.13 
 
 
363 aa  41.2  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  23.13 
 
 
379 aa  41.2  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3993  lipoprotein NlpD  23.13 
 
 
363 aa  41.2  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  23.13 
 
 
379 aa  41.2  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>