65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1087 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  100 
 
 		 523 aa  1001    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  50.52 
 
 		 524 aa  345  8e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  46.76 
 
 		 517 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  39 
 
 		 518 aa  288  1e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  48.44 
 
 		 453 aa  270  5.9999999999999995e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  47.93 
 
 		 555 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  43.58 
 
 		 564 aa  194  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  44.4 
 
 		 802 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  39.48 
 
 		 542 aa  192  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  42.57 
 
 		 590 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  37.45 
 
 		 525 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  37.45 
 
 		 525 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  42.01 
 
 		 568 aa  186  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  37.45 
 
 		 525 aa  186  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  44.02 
 
 		 673 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  42.03 
 
 		 547 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  39.38 
 
 		 589 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  45.83 
 
 		 542 aa  171  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  46.08 
 
 		 539 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  43.63 
 
 		 532 aa  166  9e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  40.98 
 
 		 585 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  47.39 
 
 		 550 aa  164  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  39.77 
 
 		 539 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  38.02 
 
 		 537 aa  152  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  42.21 
 
 		 586 aa  145  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  42.36 
 
 		 552 aa  143  7e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  38.52 
 
 		 568 aa  137  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  30.32 
 
 		 578 aa  124  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  32.35 
 
 		 543 aa  83.2  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  31.68 
 
 		 687 aa  73.6  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  31.33 
 
 		 564 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  31.37 
 
 		 571 aa  66.6  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  27.19 
 
 		 619 aa  66.6  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 526 aa  65.1  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  34.97 
 
 		 565 aa  61.2  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  30.06 
 
 		 566 aa  60.8  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  30.39 
 
 		 631 aa  60.8  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  31.91 
 
 		 566 aa  59.3  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  27.62 
 
 		 569 aa  59.3  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  30 
 
 		 551 aa  57.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  34.15 
 
 		 556 aa  57.4  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  30.99 
 
 		 540 aa  56.6  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  30.39 
 
 		 602 aa  55.5  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  31.11 
 
 		 551 aa  54.7  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  30.9 
 
 		 571 aa  54.7  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  28.5 
 
 		 572 aa  54.7  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  30.09 
 
 		 584 aa  53.1  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5013  GTP-binding proten HflX  30.33 
 
 		 404 aa  52.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0596854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  30.61 
 
 		 576 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  24.21 
 
 		 546 aa  52  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  30.61 
 
 		 586 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  30.61 
 
 		 586 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  32.62 
 
 		 629 aa  50.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  25.5 
 
 		 291 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1841  ferrous iron transport protein B  27.32 
 
 		 769 aa  47.8  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.547404  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  25.85 
 
 		 642 aa  47  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  28.57 
 
 		 571 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1176  small GTP-binding protein  30.1 
 
 		 392 aa  45.8  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668458  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  31.58 
 
 		 669 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1096  GTP-binding proten HflX  30.1 
 
 		 392 aa  45.8  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  30.38 
 
 		 294 aa  45.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  29.85 
 
 		 618 aa  43.9  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  24.1 
 
 		 585 aa  43.9  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  28.87 
 
 		 667 aa  43.5  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  24.18 
 
 		 295 aa  43.5  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>