268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0068 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  100 
 
 
557 aa  1155    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3201  L-amino-acid oxidase  46.53 
 
 
535 aa  456  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00292344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  44.38 
 
 
520 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0085  L-amino-acid oxidase  43.98 
 
 
536 aa  396  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  39.45 
 
 
524 aa  315  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  35.11 
 
 
527 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  34.75 
 
 
516 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  34.75 
 
 
516 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  34.01 
 
 
531 aa  256  8e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0148  amine oxidase  33.95 
 
 
531 aa  249  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  31.55 
 
 
530 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  31.2 
 
 
526 aa  243  7.999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  31.84 
 
 
537 aa  237  4e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  31.76 
 
 
535 aa  237  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  30.81 
 
 
533 aa  232  2e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  32.05 
 
 
528 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1720  twin-arginine translocation pathway signal  30.94 
 
 
529 aa  228  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  29.65 
 
 
519 aa  222  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  29.77 
 
 
533 aa  221  3e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2888  amine oxidase  31.08 
 
 
527 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511968  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  28.96 
 
 
532 aa  219  1e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  27.61 
 
 
541 aa  219  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  30.91 
 
 
527 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  28.13 
 
 
507 aa  187  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3896  amine oxidase  26.41 
 
 
638 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.322927  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  26.45 
 
 
478 aa  136  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2873  amine oxidase flavin-containing  25.57 
 
 
646 aa  136  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  26.71 
 
 
492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  26.42 
 
 
478 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  24.75 
 
 
478 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  24.75 
 
 
478 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  24.23 
 
 
644 aa  123  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  25.52 
 
 
487 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  25.05 
 
 
482 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  25.56 
 
 
485 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  25.05 
 
 
487 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  25.05 
 
 
482 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  25.05 
 
 
482 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  24.79 
 
 
487 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  25.15 
 
 
490 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  24.85 
 
 
478 aa  118  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  24.95 
 
 
490 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  24.59 
 
 
490 aa  114  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  23.65 
 
 
491 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  22.63 
 
 
478 aa  104  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  23.37 
 
 
482 aa  103  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  22.43 
 
 
478 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  23.03 
 
 
478 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  23.03 
 
 
478 aa  102  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  22.52 
 
 
478 aa  97.1  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  23.24 
 
 
478 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  26.19 
 
 
418 aa  85.1  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  20.7 
 
 
573 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  26.1 
 
 
564 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  24.52 
 
 
523 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  22.49 
 
 
495 aa  66.2  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  22.27 
 
 
487 aa  65.5  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  22.55 
 
 
698 aa  62.4  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  27.92 
 
 
572 aa  60.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  60.87 
 
 
496 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  60.87 
 
 
496 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03720  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  37.61 
 
 
558 aa  57.8  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  67.5 
 
 
492 aa  55.1  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0240  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.52 
 
 
652 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.931627 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  64.29 
 
 
463 aa  55.1  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  22.35 
 
 
454 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  35 
 
 
469 aa  53.9  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  63.41 
 
 
462 aa  53.5  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  54 
 
 
463 aa  52.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  30.28 
 
 
647 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  28.57 
 
 
441 aa  52  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  33.91 
 
 
647 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  33.91 
 
 
647 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  27.56 
 
 
466 aa  51.2  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6655  putative oxidoreductase  43.33 
 
 
445 aa  51.2  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.0132597 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0423  selenate reductase YgfK  65.71 
 
 
1075 aa  51.2  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  27.56 
 
 
466 aa  51.2  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  50 
 
 
476 aa  51.2  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  52.17 
 
 
761 aa  51.2  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  47.37 
 
 
465 aa  50.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0866  hydrogenase subunit, putative  40.7 
 
 
461 aa  50.4  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  27.89 
 
 
482 aa  50.8  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  56.52 
 
 
445 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  54.35 
 
 
435 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0968  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.41 
 
 
644 aa  50.4  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132179  normal  0.162387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  25.93 
 
 
624 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  34.48 
 
 
645 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5722  putative oxidoreductase  41.67 
 
 
445 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265057  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5966  putative oxidoreductase  41.67 
 
 
445 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.592617 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2205  putative oxidoreductase  62.16 
 
 
598 aa  50.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204646  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  47.37 
 
 
464 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  41.67 
 
 
444 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  23.93 
 
 
510 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  23.76 
 
 
484 aa  49.3  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1934  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.16 
 
 
691 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  hitchhiker  0.00000161131 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  35.71 
 
 
504 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1535  putative oxidoreductase  48.84 
 
 
449 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2319  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  46 
 
 
578 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000648814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  59.46 
 
 
466 aa  49.3  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87428  glutamate synthase  50 
 
 
2126 aa  49.3  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>