More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4230 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4230  ABC transporter related  100 
 
 		 621 aa  1259    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1426  ABC transporter related  49.03 
 
 		 600 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.484971 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1064  ABC transporter, transmembrane region  49.38 
 
 		 602 aa  559  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.415501  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4514  ABC transporter related  49.48 
 
 		 600 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.350646  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1596  ABC transporter related  49.48 
 
 		 600 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1292  ABC transporter related  49.03 
 
 		 601 aa  537  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5675  ABC transporter permease/ATP-binding protein  46.75 
 
 		 601 aa  534  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.400511  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1608  ABC transporter related  49.13 
 
 		 600 aa  535  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.645383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  44.27 
 
 		 595 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0238  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.25 
 
 		 596 aa  501  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  44.1 
 
 		 595 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  44.08 
 
 		 601 aa  486  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5011  ABC transporter related  44.72 
 
 		 601 aa  477  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1331  ABC transporter related  41.64 
 
 		 609 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134992  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.61 
 
 		 609 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.55 
 
 		 591 aa  464  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3848  ABC transporter related  40.95 
 
 		 585 aa  437  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135668  normal  0.677159 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1342  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.14 
 
 		 588 aa  435  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  39.73 
 
 		 624 aa  429  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.04 
 
 		 577 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.67 
 
 		 600 aa  370  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  40.03 
 
 		 611 aa  369  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  40.03 
 
 		 611 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.69 
 
 		 580 aa  368  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.14 
 
 		 585 aa  368  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  39.8 
 
 		 611 aa  363  6e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  38.53 
 
 		 611 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3561  ABC transporter, transmembrane region  39.86 
 
 		 579 aa  361  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  37.67 
 
 		 627 aa  359  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  37.46 
 
 		 618 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2942  ABC transporter, transmembrane region  38.7 
 
 		 605 aa  355  1e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.24 
 
 		 580 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  35.98 
 
 		 571 aa  350  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  35.63 
 
 		 602 aa  349  7e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  36.56 
 
 		 556 aa  348  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  37.13 
 
 		 601 aa  348  2e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  33.22 
 
 		 593 aa  344  2e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  34.68 
 
 		 582 aa  343  4e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.23 
 
 		 572 aa  341  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  37.37 
 
 		 571 aa  339  8e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.32 
 
 		 583 aa  339  9e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  40.56 
 
 		 598 aa  336  7e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4538  ABC transporter related  37.61 
 
 		 596 aa  334  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.232749 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  34.98 
 
 		 588 aa  333  4e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  36.7 
 
 		 579 aa  330  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5589  ABC transporter related  39.76 
 
 		 586 aa  330  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2996  ABC transporter related  40.51 
 
 		 596 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.637483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2874  ABC transporter related  40.03 
 
 		 597 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3100  ABC transporter related  40.03 
 
 		 597 aa  326  6e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.87066  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1141  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.39 
 
 		 586 aa  326  1e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.61 
 
 		 587 aa  324  3e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.53 
 
 		 579 aa  323  4e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.3 
 
 		 597 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.82 
 
 		 589 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  35.02 
 
 		 589 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0787  lipid export ABC transport protein  33.99 
 
 		 572 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  33.98 
 
 		 575 aa  319  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  34.91 
 
 		 584 aa  317  4e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  39.42 
 
 		 598 aa  317  5e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  30.81 
 
 		 597 aa  315  9.999999999999999e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2763  transport ATP-binding protein msbA  36.38 
 
 		 590 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.714351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.8 
 
 		 586 aa  314  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.35 
 
 		 582 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0637  ABC transporter related  39.49 
 
 		 588 aa  313  4.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.188311 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2507  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.32 
 
 		 579 aa  313  5.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33.27 
 
 		 597 aa  313  5.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0117  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.63 
 
 		 574 aa  313  6.999999999999999e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  34.51 
 
 		 610 aa  311  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.51 
 
 		 609 aa  311  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  39.62 
 
 		 601 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  39.63 
 
 		 468 aa  310  5e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.05 
 
 		 582 aa  310  5e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.71 
 
 		 583 aa  310  5.9999999999999995e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  35.36 
 
 		 608 aa  309  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  38.1 
 
 		 594 aa  309  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.38 
 
 		 582 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0964  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.6 
 
 		 601 aa  308  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.519828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.73 
 
 		 586 aa  308  3e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  38.88 
 
 		 597 aa  307  3e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  33.46 
 
 		 586 aa  308  3e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  32.64 
 
 		 609 aa  307  4.0000000000000004e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.08 
 
 		 608 aa  307  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  35.13 
 
 		 625 aa  306  6e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  36.11 
 
 		 575 aa  306  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  36.26 
 
 		 582 aa  306  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.26 
 
 		 582 aa  306  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.26 
 
 		 582 aa  306  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.26 
 
 		 582 aa  306  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  36.26 
 
 		 582 aa  306  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.26 
 
 		 582 aa  306  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.26 
 
 		 582 aa  306  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.26 
 
 		 582 aa  306  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.26 
 
 		 582 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  35.32 
 
 		 578 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.57 
 
 		 566 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  34 
 
 		 586 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  34.73 
 
 		 612 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  33.98 
 
 		 578 aa  303  8.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  33.98 
 
 		 578 aa  303  8.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3027  ABC transporter related  37.15 
 
 		 572 aa  302  9e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344484  normal  0.0453248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>