49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1630 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1630  anti-ECFsigma factor, ChrR  100 
 
 		 235 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3569  transcriptional regulator  44.49 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1553  anti-ECFsigma factor, ChrR  37.02 
 
 		 212 aa  149  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0721  anti-Sigm factor, ChrR  37.18 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.699177  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2472  anti-sigm factor, ChrR  34.2 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.483016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2958  transcriptional regulator  38.56 
 
 		 216 aa  122  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0891  transcriptional activator ChrR  33.48 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.627944 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0090  anti sigma factor protein  34.57 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0365  anti-ECFsigma factor  33.47 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.931641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1042  transcriptional activator ChrR  30.87 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.998121  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2756  anti-ECFsigma factor, ChrR  36.25 
 
 		 213 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1093  anti-sigma factor ChrR  35.83 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2935  anti-ECFsigma factor, ChrR  36.29 
 
 		 214 aa  111  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.714383  normal  0.0760187 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4076  anti-ECFsigma factor, ChrR  28.33 
 
 		 231 aa  109  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0416  anti-ECFsigma factor, ChrR  35.62 
 
 		 211 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.168999 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1867  anti-ECFsigma factor, ChrR  35.06 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947993 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0550  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.61 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.259297  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1890  putative transcriptional activator  32.07 
 
 		 226 aa  102  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4022  anti-sigm factor, ChrR  32.77 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1960  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.26 
 
 		 214 aa  95.1  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0408517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0339  anti-sigma factor ChrR, putative  34.73 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03283  hypothetical protein  28.21 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0275  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.34 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0517  anti-ECFsigma factor, ChrR  27.47 
 
 		 212 aa  89.7  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112614  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002701  putative transcriptional activator ChrR  29.88 
 
 		 219 aa  89  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1477  anti-ECFsigma factor, ChrR  28.51 
 
 		 249 aa  86.3  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.688237  normal  0.852126 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1618  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.17 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3373  anti-sigma factor ChrR, putative  27.35 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1333  anti-ECFsigma factor, ChrR  29.46 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0130181  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01438  Transcription negative regulator ChrR  28.16 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0996  anti-ECFsigma factor, ChrR  25.1 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84209 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1439  anti-ECFsigma factor, ChrR  29.46 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.297382 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2466  anti-ECFsigma factor, ChrR  27.98 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2779  anti-ECFsigma factor, ChrR  24.48 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.960019 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2037  anti-ECFsigma factor, ChrR  25.58 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.280175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0487  anti-sigm factor, ChrR  33.76 
 
 		 219 aa  72  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221511  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1378  putative transcriptional activator  22.84 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.857298  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2348  anti-ECFsigma factor, ChrR  25.51 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.527033  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2276  anti-ECFsigma factor, ChrR  25.51 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2323  anti-ECFsigma factor, ChrR  24.17 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.586398  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2319  anti-ECFsigma factor, ChrR  23.93 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1985  transcriptional activator, putative  23.63 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2598  anti-ECFsigma factor, ChrR  26.45 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2637  anti-ECFsigma factor, ChrR  26.47 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2712  anti-ECFsigma factor, ChrR  25.51 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1748  anti-ECFsigma factor, ChrR  25.51 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0800571  hitchhiker  0.00180975 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41079  predicted protein  34.85 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4481  anti-ECFsigma factor, ChrR  31.82 
 
 		 117 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0451  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.9 
 
 		 241 aa  41.6  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38082 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>