More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0855 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0855  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 308 aa  626  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.931414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1102  LysR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3249  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 297 aa  205  7e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  37.68 
 
 		 292 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 293 aa  196  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  39.08 
 
 		 301 aa  195  9e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 301 aa  195  9e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 301 aa  195  9e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  39.08 
 
 		 301 aa  195  9e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  39.08 
 
 		 301 aa  195  9e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  39.08 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  39.08 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  39.08 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  39.08 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 302 aa  192  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4355  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 298 aa  176  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 301 aa  175  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 295 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  37.41 
 
 		 304 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0767  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.88 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2909  transcriptional regulator, LysR family  35.77 
 
 		 299 aa  168  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0304015  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3750  LysR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_003296  RS04822  transcription regulator protein  38.15 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05669  transcription regulator protein  38.15 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2713  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.62 
 
 		 299 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2876  LysR family transcriptional regulator  37 
 
 		 310 aa  166  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.692087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  38.22 
 
 		 296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  38.22 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  35.76 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.78 
 
 		 297 aa  162  6e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  37.78 
 
 		 297 aa  162  6e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 297 aa  162  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 297 aa  162  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4970  transcriptional regulator, LysR family  34.83 
 
 		 298 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126085  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  37.78 
 
 		 297 aa  162  6e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1982  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1870  LysR family substrate binding transcriptional regulator  34.02 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102903  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3285  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1969  transcriptional regulator, LysR family  35.11 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2332  transcriptional regulator, LysR family  35.11 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.194223  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3927  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  37.41 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1027  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174873 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  37.41 
 
 		 297 aa  160  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 297 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6068  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 303 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5704  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 303 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6552  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 303 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.392727 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2953  LysR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 294 aa  158  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3179  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2537  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 289 aa  156  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2220  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 317 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 307 aa  156  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  34.15 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 297 aa  155  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0421  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.67 
 
 		 296 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 299 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1001  LysR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2421  LysR substrate-binding  27.49 
 
 		 300 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2053  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.79519  normal  0.0937075 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6115  transcriptional regulator, LysR family  35.52 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1181  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  35.74 
 
 		 331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  34.67 
 
 		 302 aa  153  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4596  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651674 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2282  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 302 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0266423 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  34.69 
 
 		 294 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3471  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 305 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1134  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0828  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  35.71 
 
 		 320 aa  152  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.767447  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0242  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 312 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2752  transcriptional regulator, LysR family  32.08 
 
 		 298 aa  152  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000767643 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2671  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 299 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0656105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2778  transcriptional regulator, LysR family  33.72 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23055  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1408  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0578  LysR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>