122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4756 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  61.55 
 
 
615 aa  649    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  69.64 
 
 
618 aa  703    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  68.06 
 
 
606 aa  703    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 
506 aa  1019    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  67.86 
 
 
606 aa  701    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  60.99 
 
 
599 aa  618  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2901  peptidase M14, carboxypeptidase A  52.87 
 
 
585 aa  511  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.55349  normal  0.0629312 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  27.13 
 
 
541 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.08 
 
 
627 aa  94  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2083  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.03 
 
 
634 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0146  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.43 
 
 
683 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0100  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.86 
 
 
619 aa  87.4  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.719782  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0142  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.43 
 
 
683 aa  87  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.22 
 
 
683 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.32 
 
 
684 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24600  putative carboxypeptidase  26.03 
 
 
634 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  21.85 
 
 
627 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0143  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.92 
 
 
663 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.15 
 
 
609 aa  81.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.86 
 
 
612 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.8 
 
 
659 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.8 
 
 
658 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.22 
 
 
665 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0033  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.21 
 
 
613 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  25.44 
 
 
592 aa  78.2  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0161  carboxypeptidase  21.11 
 
 
610 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4365  carboxypeptidase  21.33 
 
 
615 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.71 
 
 
581 aa  73.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  31.06 
 
 
351 aa  69.7  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1519  peptidase M14, carboxypeptidase A  36.79 
 
 
398 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.96 
 
 
581 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.55 
 
 
581 aa  67  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.43 
 
 
384 aa  65.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.85 
 
 
497 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5441  hypothetical protein  33.96 
 
 
490 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  33.65 
 
 
490 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0217728 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.28 
 
 
393 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  32 
 
 
361 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  36.27 
 
 
840 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5095  peptidase, family M14  22.41 
 
 
576 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000522149  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  35.58 
 
 
392 aa  62  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2692  zinc carboxypeptidase family protein  31.1 
 
 
429 aa  61.2  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0016795  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.74 
 
 
631 aa  59.7  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10433  hypothetical protein  28.57 
 
 
388 aa  58.9  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.968158  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2049  peptidase, family M14  20.92 
 
 
484 aa  58.9  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.270897  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3879  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.38 
 
 
422 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0312  hypothetical protein  37 
 
 
293 aa  57  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.44 
 
 
580 aa  57  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  25.83 
 
 
885 aa  57  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5008  deacylase-like protein  37 
 
 
293 aa  56.6  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1132  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.92 
 
 
400 aa  54.7  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.27 
 
 
500 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1583  hypothetical protein  44.07 
 
 
452 aa  54.3  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0370379 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  25.73 
 
 
858 aa  53.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.88 
 
 
852 aa  52.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.22 
 
 
845 aa  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1725  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.9 
 
 
355 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.62 
 
 
850 aa  51.6  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.36 
 
 
526 aa  51.2  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.48 
 
 
453 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6842  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.52 
 
 
577 aa  50.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.922108  normal  0.679276 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  29.6 
 
 
821 aa  49.7  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.82 
 
 
262 aa  49.3  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.3 
 
 
848 aa  48.9  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5203  hypothetical protein  26.09 
 
 
1057 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  31.34 
 
 
1247 aa  49.3  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.43 
 
 
378 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1827  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.79 
 
 
911 aa  48.5  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000101368  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2633  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.12 
 
 
887 aa  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.181298  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3277  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34 
 
 
406 aa  48.5  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2299  murein peptide amidase A  31.11 
 
 
242 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0158  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.53 
 
 
848 aa  48.5  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1734  murein peptide amidase A  31.3 
 
 
249 aa  47.8  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461062  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1975  Zinc carboxypeptidase-related protein  36.99 
 
 
342 aa  47.4  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2472  oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring)  38.46 
 
 
341 aa  47.4  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.319923  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1558  murein peptide amidase A  30.37 
 
 
262 aa  47  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1470  murein peptide amidase A  30.37 
 
 
242 aa  47.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5494  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.92 
 
 
218 aa  47.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136631  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.37 
 
 
862 aa  47  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01303  murein peptide amidase A  30.37 
 
 
262 aa  47  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2320  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.37 
 
 
262 aa  47  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.250489  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_4102  predicted protein  33.33 
 
 
241 aa  47  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  unclonable  0.0000187913 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1442  murein peptide amidase A  30.37 
 
 
262 aa  47  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1804  murein peptide amidase A  30.37 
 
 
242 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000928134 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1652  murein peptide amidase A  30.37 
 
 
242 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.609177  normal  0.0125995 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2367  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.49 
 
 
580 aa  47  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.639683  normal  0.513126 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01314  hypothetical protein  30.37 
 
 
262 aa  47  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.107648  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1797  murein peptide amidase A  29.63 
 
 
242 aa  47  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1970  murein peptide amidase A  30.37 
 
 
242 aa  47  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.996708  normal  0.386863 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3749  hypothetical protein  35.21 
 
 
275 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2354  zinc carboxypeptidase-related protein  36.99 
 
 
341 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1866  murein peptide amidase A  30.37 
 
 
242 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1805  murein peptide amidase A  29.92 
 
 
242 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.561164  normal  0.438296 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  33.33 
 
 
365 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2282  zinc carboxypeptidase-related protein  36.99 
 
 
346 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.548754  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3092  hypothetical protein  33.33 
 
 
275 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00006748  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0843  hypothetical protein  33.33 
 
 
275 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2643  zinc carboxypeptidase-related protein  35.62 
 
 
342 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1536  murein peptide amidase A  30.37 
 
 
242 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1742  zinc carboxypeptidase-related protein  35.62 
 
 
342 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.212306  hitchhiker  0.00119795 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>