More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4160 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  100 
 
 		 419 aa  859    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  46.34 
 
 		 420 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  44.47 
 
 		 439 aa  351  1e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  46.23 
 
 		 422 aa  351  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  45.23 
 
 		 419 aa  350  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  44.28 
 
 		 422 aa  346  5e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  43.31 
 
 		 420 aa  320  3e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  43.45 
 
 		 418 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  41.87 
 
 		 425 aa  285  7e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  40.97 
 
 		 405 aa  269  5.9999999999999995e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  39.38 
 
 		 403 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  37.05 
 
 		 432 aa  260  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  38.01 
 
 		 404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  36.63 
 
 		 404 aa  247  4e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04051  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37 
 
 		 415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0550  phage integrase family protein  34.64 
 
 		 413 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0350  phage integrase family protein  34.74 
 
 		 427 aa  199  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4258  phage integrase family site specific recombinase  36.33 
 
 		 293 aa  164  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  32.08 
 
 		 515 aa  164  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  30.53 
 
 		 410 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  30.1 
 
 		 409 aa  160  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4176  hypothetical protein  63.56 
 
 		 161 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  30.1 
 
 		 414 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4175  hypothetical protein  60.77 
 
 		 204 aa  159  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.981861 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  30.1 
 
 		 409 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  30.37 
 
 		 409 aa  154  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5642  Phage integrase  31.91 
 
 		 403 aa  150  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000734  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  30.08 
 
 		 413 aa  147  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  27.33 
 
 		 440 aa  144  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  26.41 
 
 		 414 aa  143  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  26.21 
 
 		 414 aa  141  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  28.69 
 
 		 406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  27.7 
 
 		 401 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  30.51 
 
 		 414 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  27.44 
 
 		 401 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  28.72 
 
 		 412 aa  136  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  29.57 
 
 		 394 aa  136  8e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  29.38 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  28.22 
 
 		 404 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  29.16 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  29.34 
 
 		 445 aa  130  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  26.87 
 
 		 409 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  26.36 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  30.48 
 
 		 413 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  25.82 
 
 		 395 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  27.07 
 
 		 414 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  30.5 
 
 		 413 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3013  phage integrase family site specific recombinase  28.71 
 
 		 419 aa  123  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  26.92 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2875  phage integrase family protein  26.9 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.698524  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  24.58 
 
 		 411 aa  121  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  26.75 
 
 		 396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  28.04 
 
 		 434 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  26.01 
 
 		 394 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  25.14 
 
 		 387 aa  120  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  27.89 
 
 		 439 aa  120  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  28.23 
 
 		 404 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.75 
 
 		 394 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  28.1 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  26.93 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  26.77 
 
 		 410 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0927  integrase family protein  27.14 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.75 
 
 		 394 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  26.84 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.19 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  25.19 
 
 		 410 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  27.14 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  28.47 
 
 		 389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  28.4 
 
 		 455 aa  117  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  26.04 
 
 		 391 aa  117  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  25.75 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  26.75 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  26.3 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  25.95 
 
 		 418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  28.39 
 
 		 412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  26.41 
 
 		 427 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  25.77 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  25.52 
 
 		 408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  26.18 
 
 		 420 aa  113  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  27.48 
 
 		 446 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  27.62 
 
 		 413 aa  113  7.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  26.29 
 
 		 426 aa  113  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3466  integrase family protein  26.54 
 
 		 644 aa  112  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  26.82 
 
 		 426 aa  112  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  27.22 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  25.9 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  25.75 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  26.39 
 
 		 409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  26.89 
 
 		 419 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  26.39 
 
 		 409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  26.39 
 
 		 436 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  25.8 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  25.3 
 
 		 418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  27.58 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  25.65 
 
 		 449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  25.54 
 
 		 405 aa  111  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  26.88 
 
 		 395 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  26.7 
 
 		 411 aa  111  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  27.58 
 
 		 411 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2526  Phage integrase  26.24 
 
 		 481 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000237436  normal  0.0434699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>