More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0412 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0412  ABC transporter related  100 
 
 		 530 aa  1063    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  60.69 
 
 		 535 aa  627  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3819  ABC transporter related  54.8 
 
 		 551 aa  567  1e-160  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  54.28 
 
 		 543 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  53.53 
 
 		 543 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  53.72 
 
 		 543 aa  552  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  51.49 
 
 		 545 aa  550  1e-155  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  55.3 
 
 		 540 aa  548  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  54.73 
 
 		 540 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3520  peptide ABC transporter ATPase  54.73 
 
 		 540 aa  538  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206923  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5076  ABC transporter related  52.25 
 
 		 538 aa  520  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.058273  normal  0.492539 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6327  ABC transporter related  52.49 
 
 		 551 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.21 
 
 		 611 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.414615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  49.72 
 
 		 613 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  49.16 
 
 		 613 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  50.84 
 
 		 531 aa  500  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6060  ABC transporter related  49.91 
 
 		 621 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  49.81 
 
 		 608 aa  496  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6357  ABC transporter related  50.09 
 
 		 624 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6274  ABC transporter related  49.54 
 
 		 624 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.0524349 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1498  ABC peptide transporter, ATPase subunit  49.91 
 
 		 614 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0723717  hitchhiker  0.00895491 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6441  ABC transporter related  49.54 
 
 		 624 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6676  ABC transporter related  49.54 
 
 		 624 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.44 
 
 		 614 aa  488  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5637  ABC transporter related  50.68 
 
 		 550 aa  485  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  47.18 
 
 		 613 aa  484  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0789  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  47.94 
 
 		 665 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  49.33 
 
 		 582 aa  478  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2190  ABC transporter-related protein  49.25 
 
 		 546 aa  472  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1540  ABC transporter related  48.44 
 
 		 603 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.798313 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5003  ABC transporter related  46.47 
 
 		 551 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.185107 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5301  ABC transporter related  46 
 
 		 551 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5661  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.03 
 
 		 553 aa  462  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755522  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2917  ABC transporter related  48.08 
 
 		 557 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1925  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.08 
 
 		 552 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5591  ABC transporter related  47.11 
 
 		 551 aa  448  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.395056 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4958  ABC transporter related  46.28 
 
 		 553 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.129875 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  44.32 
 
 		 534 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  41.97 
 
 		 532 aa  379  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  43.18 
 
 		 534 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  41.97 
 
 		 543 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  39.45 
 
 		 584 aa  367  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  41.97 
 
 		 543 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  41.97 
 
 		 543 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  40.19 
 
 		 535 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  42.48 
 
 		 538 aa  365  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  39.65 
 
 		 565 aa  364  2e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  36.97 
 
 		 572 aa  363  3e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.87 
 
 		 540 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  40.19 
 
 		 560 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  39.51 
 
 		 553 aa  363  6e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  39.53 
 
 		 571 aa  362  7.0000000000000005e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  41.57 
 
 		 540 aa  362  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  41.83 
 
 		 592 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3129  ABC transporter related  39.42 
 
 		 582 aa  362  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  42.03 
 
 		 544 aa  361  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  41.63 
 
 		 592 aa  361  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  37.29 
 
 		 564 aa  360  3e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  40.68 
 
 		 532 aa  360  3e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  39.89 
 
 		 550 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  37.66 
 
 		 593 aa  359  6e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.25 
 
 		 548 aa  359  6e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  38.98 
 
 		 539 aa  358  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3716  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.11 
 
 		 524 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  40.23 
 
 		 552 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  38.13 
 
 		 545 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  37.64 
 
 		 599 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  40.41 
 
 		 550 aa  356  5e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  39.01 
 
 		 568 aa  355  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  35.9 
 
 		 539 aa  355  1e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  40.91 
 
 		 534 aa  355  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  41.05 
 
 		 592 aa  355  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  39.24 
 
 		 540 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  40.04 
 
 		 557 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  37.78 
 
 		 611 aa  353  4e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  39.16 
 
 		 546 aa  353  5e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  39.74 
 
 		 541 aa  352  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  38.45 
 
 		 566 aa  351  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  39.25 
 
 		 555 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  39.29 
 
 		 593 aa  350  3e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  41.95 
 
 		 551 aa  350  3e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.23 
 
 		 546 aa  350  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  39.38 
 
 		 562 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  41.73 
 
 		 549 aa  350  5e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  38.84 
 
 		 619 aa  350  5e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  37.59 
 
 		 601 aa  349  6e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  38.41 
 
 		 609 aa  349  6e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  40.3 
 
 		 541 aa  349  8e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3487  ABC transporter related  41.51 
 
 		 552 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  39.06 
 
 		 555 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  39.25 
 
 		 616 aa  348  2e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  38.58 
 
 		 571 aa  348  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  39.55 
 
 		 568 aa  348  2e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  37.28 
 
 		 623 aa  348  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  38.55 
 
 		 573 aa  347  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1083  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.35 
 
 		 669 aa  348  2e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  41.09 
 
 		 585 aa  347  3e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  40 
 
 		 545 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  37.28 
 
 		 629 aa  347  3e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  39.03 
 
 		 867 aa  347  3e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>