175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3593 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3593  YadA domain protein  100 
 
 		 742 aa  1337    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.50488  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  34.72 
 
 		 3192 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  36.52 
 
 		 877 aa  127  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  42.13 
 
 		 827 aa  125  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  32.38 
 
 		 737 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2684  hemagluttinin family protein  39.07 
 
 		 706 aa  121  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  36.64 
 
 		 1068 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  35.95 
 
 		 617 aa  112  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  43.75 
 
 		 1012 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  37.64 
 
 		 2832 aa  108  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  43.27 
 
 		 962 aa  106  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  38.81 
 
 		 1326 aa  105  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  41.5 
 
 		 536 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  41.97 
 
 		 715 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  41.97 
 
 		 1535 aa  99.8  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  42.19 
 
 		 597 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  41.97 
 
 		 1705 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  41.97 
 
 		 1766 aa  100  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  41.97 
 
 		 1626 aa  99.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  42.19 
 
 		 597 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  42.19 
 
 		 597 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  41.97 
 
 		 1669 aa  99.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  38.91 
 
 		 655 aa  99  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  42.93 
 
 		 1654 aa  99  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  50.32 
 
 		 810 aa  98.6  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  39.69 
 
 		 967 aa  96.3  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  35.69 
 
 		 1072 aa  96.3  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  39.68 
 
 		 589 aa  92.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  54.21 
 
 		 533 aa  92  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  31.88 
 
 		 735 aa  91.3  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  58.33 
 
 		 472 aa  91.3  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0878  hemagglutinin domain-containing protein  44.76 
 
 		 525 aa  90.9  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  32.61 
 
 		 4384 aa  90.1  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  38.8 
 
 		 575 aa  90.1  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  32.35 
 
 		 1417 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  36.28 
 
 		 1613 aa  89  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  39 
 
 		 2868 aa  87.8  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  34.35 
 
 		 4191 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  35.47 
 
 		 816 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  35.47 
 
 		 816 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  35.47 
 
 		 816 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  35.47 
 
 		 831 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  35.47 
 
 		 831 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  46.48 
 
 		 1265 aa  85.5  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  35.47 
 
 		 820 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  35.47 
 
 		 816 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  35.47 
 
 		 831 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2793  hemagluttinin-like protein  48.09 
 
 		 601 aa  84  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  47.86 
 
 		 2392 aa  83.6  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  44.44 
 
 		 1197 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  44.44 
 
 		 1197 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  43.7 
 
 		 1451 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  44.44 
 
 		 1197 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0142  hypothetical protein  30.43 
 
 		 548 aa  80.9  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  42.86 
 
 		 1246 aa  80.9  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  42.26 
 
 		 3126 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  42.96 
 
 		 1125 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  42.96 
 
 		 1204 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  40.65 
 
 		 1616 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  38.6 
 
 		 1309 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  40.65 
 
 		 1588 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  40.65 
 
 		 1616 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  40.65 
 
 		 1616 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  36.57 
 
 		 460 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  36.57 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  38.86 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  38.86 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0146  hypothetical protein  40.94 
 
 		 135 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0122  haemagluttinin family protein  40.94 
 
 		 135 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  31.86 
 
 		 3635 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  35.17 
 
 		 373 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  35.17 
 
 		 378 aa  77  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  35.17 
 
 		 373 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  32.95 
 
 		 1186 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  42.57 
 
 		 963 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  32.53 
 
 		 3718 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  28.97 
 
 		 1190 aa  73.9  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  30.22 
 
 		 1117 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  36.79 
 
 		 1674 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  37.28 
 
 		 1854 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  29.14 
 
 		 1440 aa  73.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  31.32 
 
 		 3355 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  39.71 
 
 		 2505 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  40.96 
 
 		 977 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  45.88 
 
 		 876 aa  69.3  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  47.06 
 
 		 880 aa  69.7  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  35.34 
 
 		 1549 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  37.11 
 
 		 1546 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  37.11 
 
 		 1471 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  37.11 
 
 		 1471 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  38.69 
 
 		 2866 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  38.58 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5048  hemagluttinin domain-containing protein  39.85 
 
 		 2814 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3144  hemagluttinin motif-containing protein  39.85 
 
 		 2728 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5223  hemagluttinin domain-containing protein  39.85 
 
 		 2778 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224013 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  42 
 
 		 1814 aa  67  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  37.34 
 
 		 1472 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  45.57 
 
 		 878 aa  65.1  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2048  putative outer membrane protein  38.95 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0459  haemagluttinin family protein  36.81 
 
 		 2757 aa  64.7  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.312259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>