80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2051 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2051  protein of unknown function DUF305  100 
 
 		 171 aa  352  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3245  hypothetical protein  63.06 
 
 		 167 aa  200  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1322  hypothetical protein  61.96 
 
 		 166 aa  197  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.338762 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3896  hypothetical protein  64.94 
 
 		 167 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2287  hypothetical protein  66.44 
 
 		 151 aa  195  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000356026  hitchhiker  0.00039069 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4811  hypothetical protein  59.33 
 
 		 161 aa  190  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4925  hypothetical protein  59.71 
 
 		 147 aa  157  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2420  hypothetical protein  48.59 
 
 		 147 aa  136  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6892  protein of unknown function DUF305  40.61 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4398  hypothetical protein  43.36 
 
 		 157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3077  hypothetical protein  37.25 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11708  hypothetical protein  37.11 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6962  protein of unknown function DUF305  37.09 
 
 		 161 aa  105  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211177  normal  0.0771819 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11363  hypothetical protein  38.46 
 
 		 161 aa  103  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0712  hypothetical protein  35.17 
 
 		 158 aa  94.7  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118157 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0695  hypothetical protein  33.56 
 
 		 161 aa  94  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000975548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6646  protein of unknown function DUF305  42.14 
 
 		 170 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.350625  normal  0.51653 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3677  hypothetical protein  36.25 
 
 		 297 aa  91.3  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.160508 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0287  protein of unknown function DUF305  35.19 
 
 		 201 aa  90.9  9e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.087537 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3594  hypothetical protein  36.55 
 
 		 278 aa  90.5  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0376172  normal  0.29662 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3932  hypothetical protein  36.55 
 
 		 278 aa  90.5  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.609829  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1589  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000759319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0010  protein of unknown function DUF305  35.06 
 
 		 173 aa  89  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0359  protein of unknown function DUF305  36.69 
 
 		 178 aa  85.5  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1170  protein of unknown function DUF305  31.91 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2305  hypothetical protein  34.19 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.775317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1088  hypothetical protein  30.72 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1942  hypothetical protein  39.18 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4663  hypothetical protein  38.68 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000351024 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00407  hypothetical protein  44.44 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  43.33 
 
 		 131 aa  51.6  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5858  hypothetical protein  45.16 
 
 		 218 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6564  hypothetical protein  48.33 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6278  hypothetical protein  38.2 
 
 		 130 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531992 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  48.39 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  44.26 
 
 		 137 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  45 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  43.33 
 
 		 132 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1876  hypothetical protein  49.15 
 
 		 141 aa  47.8  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.257011  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1967  hypothetical protein  49.15 
 
 		 141 aa  47.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619841  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5510  hypothetical protein  46.67 
 
 		 130 aa  47.4  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.563471  normal  0.269299 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1290  hypothetical protein  45.76 
 
 		 127 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  36.13 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  43.1 
 
 		 237 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0406  hypothetical protein  49.15 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  43.1 
 
 		 243 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6541  hypothetical protein  45.76 
 
 		 127 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  43.1 
 
 		 237 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5258  hypothetical protein  52.94 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.355958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6148  hypothetical protein  45.76 
 
 		 127 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137676  normal  0.19662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  31.4 
 
 		 134 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  43.1 
 
 		 128 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1985  hypothetical protein  50.98 
 
 		 128 aa  45.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  43.33 
 
 		 120 aa  45.1  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  46.3 
 
 		 211 aa  44.7  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  45.1 
 
 		 116 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5409  hypothetical protein  40.32 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.175735 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  42.86 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  40.35 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5699  hypothetical protein  40.32 
 
 		 227 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  38.89 
 
 		 224 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5320  hypothetical protein  40.32 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  45.1 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  37.29 
 
 		 217 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  38.6 
 
 		 257 aa  43.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  41.38 
 
 		 128 aa  42.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  37.5 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  41.82 
 
 		 125 aa  42.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  40 
 
 		 135 aa  42  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  46.15 
 
 		 202 aa  42  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  42.37 
 
 		 119 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  29.11 
 
 		 217 aa  41.6  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4192  hypothetical protein  38.18 
 
 		 213 aa  41.6  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4292  hypothetical protein  38.18 
 
 		 213 aa  41.6  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4461  hypothetical protein  38.18 
 
 		 213 aa  41.6  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0997  protein of unknown function DUF305  38.6 
 
 		 148 aa  41.2  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  0.061691 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  41.38 
 
 		 205 aa  40.8  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  42.59 
 
 		 128 aa  40.8  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  39.19 
 
 		 199 aa  40.8  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>