More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2031 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2031  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  100 
 
 		 245 aa  503  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2560  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  90.57 
 
 		 245 aa  462  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.562191  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3602  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  89.39 
 
 		 245 aa  457  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0780439  normal  0.144025 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2479  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  89.75 
 
 		 245 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2347  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  88.43 
 
 		 244 aa  447  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  86.07 
 
 		 245 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.400825 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  86.48 
 
 		 245 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.882283  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  81.56 
 
 		 245 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1868  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  80.33 
 
 		 245 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0923783  normal  0.101026 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2803  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  79.92 
 
 		 245 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000483642 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2141  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  79.1 
 
 		 245 aa  404  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.968108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  76.73 
 
 		 246 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  76.73 
 
 		 246 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  76.73 
 
 		 246 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  76.73 
 
 		 246 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  76.73 
 
 		 248 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  76.73 
 
 		 246 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  76.73 
 
 		 246 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1585  acetyacetyl-CoA reductase  76.33 
 
 		 246 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  76.33 
 
 		 260 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0971  acetyacetyl-CoA reductase  76.33 
 
 		 246 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  76.33 
 
 		 246 aa  384  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1914  acetyacetyl-CoA reductase  75.92 
 
 		 246 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.044907 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  75.1 
 
 		 246 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.142964 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1727  acetyacetyl-CoA reductase  75.92 
 
 		 246 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337687  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1349  acetyacetyl-CoA reductase  75.1 
 
 		 246 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5090  acetyacetyl-CoA reductase  75.1 
 
 		 246 aa  380  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1813  acetyacetyl-CoA reductase  75.51 
 
 		 246 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486438 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2341  acetyacetyl-CoA reductase  74.69 
 
 		 246 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6290  acetyacetyl-CoA reductase  75.51 
 
 		 246 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1700  acetyacetyl-CoA reductase  75.92 
 
 		 246 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1789  acetyacetyl-CoA reductase  75.51 
 
 		 246 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0924  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  74.59 
 
 		 246 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  73.06 
 
 		 246 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1633  acetyacetyl-CoA reductase  73.06 
 
 		 246 aa  373  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.389319 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0181  acetoacetyl-CoA reductase  71.84 
 
 		 246 aa  371  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0243891 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23650  Acetoacetl-CoA reductase in PHB biosynthesis  63.27 
 
 		 247 aa  329  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02411  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  58.37 
 
 		 246 aa  310  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3122  acetoacetyl-CoA reductase  61.63 
 
 		 246 aa  308  5e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.868541  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0254  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  57.32 
 
 		 246 aa  305  6e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0283  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  57.32 
 
 		 246 aa  305  6e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3362  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  58.37 
 
 		 246 aa  304  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  58.2 
 
 		 246 aa  281  9e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  58.02 
 
 		 246 aa  275  4e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  55.06 
 
 		 247 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2771  acetoacetyl-CoA reductase  55.06 
 
 		 264 aa  272  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  55.06 
 
 		 264 aa  272  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0544  acetoacetyl-CoA reductase  54.25 
 
 		 247 aa  271  9e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2823  acetoacetyl-CoA reductase  54.25 
 
 		 247 aa  270  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2690  acetoacetyl-CoA reductase  54.25 
 
 		 247 aa  270  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685514  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5342  acetoacetyl-CoA reductase  54.69 
 
 		 251 aa  269  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2601  acetoacetyl-CoA reductase  52.65 
 
 		 248 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  54.69 
 
 		 248 aa  268  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0166  acetoacetyl-CoA reductase  52.65 
 
 		 248 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0193  acetoacetyl-CoA reductase  52.65 
 
 		 248 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1014  acetoacetyl-CoA reductase  52.65 
 
 		 248 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1337  acetoacetyl-CoA reductase  52.65 
 
 		 248 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2744  acetoacetyl-CoA reductase  52.24 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163143  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5895  acetoacetyl-CoA reductase  55.1 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.210588 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0557  acetoacetyl-CoA reductase  56 
 
 		 248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.306822  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6018  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  53.04 
 
 		 247 aa  265  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5566  acetoacetyl-CoA reductase  51.43 
 
 		 248 aa  265  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1166  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  53.44 
 
 		 247 aa  264  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0201131  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1610  acetoacetyl-CoA reductase  57.09 
 
 		 247 aa  264  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.710856 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0461  acetoacetyl-CoA reductase  52.65 
 
 		 248 aa  264  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.957228  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3865  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  54.25 
 
 		 277 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4127  acetoacetyl-CoA reductase  53.44 
 
 		 247 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5756  acetoacetyl-CoA reductase  53.91 
 
 		 249 aa  262  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.788384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4287  acetoacetyl-CoA reductase  52.65 
 
 		 248 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250358  normal  0.289691 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2782  acetoacetyl-CoA reductase  55.08 
 
 		 236 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3819  acetoacetyl-CoA reductase  52.24 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  normal  0.774133 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  53.28 
 
 		 248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6101  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  54.66 
 
 		 236 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  53.69 
 
 		 248 aa  256  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  53.69 
 
 		 248 aa  256  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1131  acetoacetyl-CoA reductase  49.59 
 
 		 248 aa  255  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.45 
 
 		 203 aa  254  7e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1515  acetoacetyl-CoA reductase  54.29 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0732362  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1198  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  52.85 
 
 		 249 aa  251  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1333  acetoacetyl-CoA reductase  51.64 
 
 		 248 aa  251  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1025  acetoacetyl-CoA reductase  52.24 
 
 		 248 aa  249  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4545  acetoacetyl-CoA reductase  50 
 
 		 248 aa  248  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00570408 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4412  acetoacetyl-CoA reductase  50 
 
 		 248 aa  248  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2205  acetoacetyl-CoA reductase  51.85 
 
 		 248 aa  248  9e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000734439  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2625  acetoacetyl-CoA reductase  50.41 
 
 		 248 aa  245  6e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4514  acetoacetyl-CoA reductase  53.11 
 
 		 241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3668  acetoacetyl-CoA reductase  53.5 
 
 		 242 aa  241  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.814536  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3470  acetoacetyl-CoA reductase  53.5 
 
 		 242 aa  240  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3778  acetoacetyl-CoA reductase  53.09 
 
 		 242 aa  239  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.576302  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2997  acetoacetyl-CoA reductase  52.26 
 
 		 241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.685049 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  49.39 
 
 		 252 aa  238  5e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1247  acetoacetyl-CoA reductase  51.44 
 
 		 241 aa  238  9e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3029  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  53.11 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05365  acetoacetyl-CoA reductase  51.01 
 
 		 268 aa  237  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1519  acetoacetyl-CoA reductase  50.81 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.004615  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5916  acetoacetyl-CoA reductase  52.63 
 
 		 242 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4780  acetoacetyl-CoA reductase  52.63 
 
 		 242 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5119  acetoacetyl-CoA reductase  52.07 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28454  normal  0.417051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5281  acetoacetyl-CoA reductase  52.44 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0426  acetoacetyl-CoA reductase  51.24 
 
 		 241 aa  234  7e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.346827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>