More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II1012 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II1012  response regulator, histidine kinase  100 
 
 		 578 aa  1189    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1753  sensor protein LuxQ  50.17 
 
 		 583 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.042622 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2833  histidine kinase  48.15 
 
 		 576 aa  530  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535084 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003159  probable sensor/response regulator hybrid  42.63 
 
 		 566 aa  424  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01913  signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 		 526 aa  382  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.86 
 
 		 631 aa  297  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  39.9 
 
 		 651 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  39.7 
 
 		 651 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.21 
 
 		 863 aa  274  4.0000000000000004e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.29 
 
 		 645 aa  266  8e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 		 633 aa  266  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.69 
 
 		 781 aa  264  4e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  36.01 
 
 		 736 aa  262  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.79 
 
 		 765 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 		 695 aa  257  5e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  37.7 
 
 		 620 aa  253  6e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  37.38 
 
 		 641 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 643 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5254  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 		 579 aa  252  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601488  normal  0.0228125 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 		 785 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 643 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 		 643 aa  250  6e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.62 
 
 		 850 aa  249  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 		 939 aa  249  9e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.42 
 
 		 846 aa  248  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3416  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 		 878 aa  246  6e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4427  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 		 772 aa  246  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37 
 
 		 643 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 		 717 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.99 
 
 		 674 aa  246  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  37.4 
 
 		 758 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.86 
 
 		 877 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 		 923 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.46 
 
 		 1199 aa  244  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  35.55 
 
 		 641 aa  244  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 		 606 aa  244  5e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  34.83 
 
 		 631 aa  243  6e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 1452 aa  243  7e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.5 
 
 		 1350 aa  243  9e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.76 
 
 		 827 aa  242  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 		 864 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.68 
 
 		 995 aa  242  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  36.69 
 
 		 1060 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.77 
 
 		 865 aa  242  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003464  signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 573 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.49 
 
 		 764 aa  241  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 		 1068 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 		 1691 aa  239  8e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 		 1195 aa  239  9e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 631 aa  239  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2513  ATP-binding region, ATPase-like  34.78 
 
 		 945 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.543755  normal  0.160676 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 		 1350 aa  239  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 		 916 aa  238  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.78 
 
 		 866 aa  238  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 		 667 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.11 
 
 		 738 aa  238  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  37.34 
 
 		 968 aa  238  3e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  35.29 
 
 		 732 aa  237  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 902 aa  236  6e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 		 973 aa  236  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 		 957 aa  236  7e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  38.66 
 
 		 738 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 		 969 aa  235  1.0000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1560  response regulator, histidine kinase  34.81 
 
 		 697 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0213368  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 		 1059 aa  236  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 		 868 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02306  hypothetical protein  36.04 
 
 		 576 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 		 1078 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  37.14 
 
 		 606 aa  234  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1360  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.7 
 
 		 644 aa  234  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.528402  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 		 601 aa  234  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.22 
 
 		 907 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 		 876 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 		 767 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 		 969 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 		 846 aa  234  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.64 
 
 		 724 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 		 873 aa  233  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1601  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.86 
 
 		 685 aa  233  6e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0518398  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 		 645 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 969 aa  233  8.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2194  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 		 858 aa  233  9e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.857252  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0460  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.87 
 
 		 835 aa  232  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.980587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 		 1596 aa  232  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3852  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 879 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0452097  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  34.33 
 
 		 853 aa  232  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 		 984 aa  232  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 		 718 aa  232  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 		 1075 aa  232  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.1 
 
 		 877 aa  232  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  37.11 
 
 		 559 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 		 802 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3783  histidine kinase  38.15 
 
 		 737 aa  232  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18481  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2547  histidine kinase  36.13 
 
 		 698 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.795977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 		 572 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2521  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 		 597 aa  231  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.08 
 
 		 582 aa  231  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.31 
 
 		 604 aa  231  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  34.43 
 
 		 882 aa  231  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 627 aa  230  4e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>