67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0628 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  314  2e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  51.37 
 
 		 152 aa  163  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  48.37 
 
 		 169 aa  159  9e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  43.66 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  30.72 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  28.66 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  29.56 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  35 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  40.43 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  40.43 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  32.94 
 
 		 198 aa  67  0.00000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  34.03 
 
 		 217 aa  63.9  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  34.09 
 
 		 634 aa  63.5  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  28.77 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  32.68 
 
 		 186 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0542  RDD family protein  35.16 
 
 		 216 aa  57  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  31.47 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0098  RDD domain containing protein  26.42 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  27.46 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  29.17 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  31.08 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  26.57 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  29.93 
 
 		 295 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  30.38 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0491  RDD family protein  33.33 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.628984  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  32.87 
 
 		 211 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0598  RDD domain containing protein  32.39 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0950  RDD protein  26.67 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  29.93 
 
 		 185 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1267  hypothetical protein  28.47 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1388  hypothetical protein  28.47 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1260  RDD protein  35.29 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  32.47 
 
 		 406 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  26.43 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07960  predicted membrane protein/domain  35.71 
 
 		 221 aa  50.4  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1908  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0425  RDD protein  34.85 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  29.41 
 
 		 424 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1103  hypothetical protein  37.68 
 
 		 284 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.200341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0474  hypothetical protein  27.01 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.647005  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0230  hypothetical protein  27.69 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  29.79 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  27.08 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0257  hypothetical protein  27.07 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0283  hypothetical protein  26.92 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  29.03 
 
 		 202 aa  46.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  32.88 
 
 		 162 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1213  RDD  35.82 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0799296  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  26.53 
 
 		 310 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0161  RDD  31.17 
 
 		 328 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  32.88 
 
 		 162 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  25 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  32.88 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  29.33 
 
 		 258 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  30.94 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  26.95 
 
 		 257 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0793  hypothetical protein  28.29 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  31.51 
 
 		 162 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  32.93 
 
 		 194 aa  43.9  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  32.05 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1510  conserved hypothetical protein (RDD domain protein)  26.81 
 
 		 138 aa  42  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  28.77 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3673  RDD domain containing protein  29.41 
 
 		 323 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03632  hypothetical protein  26.58 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0008  hypothetical protein  27.92 
 
 		 171 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.018988  normal  0.471387 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1594  hypothetical protein  29.49 
 
 		 180 aa  40.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00724024  normal  0.486335 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  26.53 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>