112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0135 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0135  putative cytochrome b561  100 
 
 		 179 aa  367  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.81104  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04738  cytochrome b561  53.29 
 
 		 195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4238  cytochrome B561  44.05 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.482827  normal  0.295562 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1444  cytochrome B561  36.75 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296577  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05609  hypothetical protein  48.54 
 
 		 141 aa  92.8  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1418  nickel-dependent hydrogenases B-type cytochrome subunit family protein  33.13 
 
 		 171 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  27.17 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  32.97 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  29.55 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  28.65 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  31.49 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  25.41 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  29.14 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  28.99 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  28.88 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  26.84 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  27.93 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  27.78 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  25.86 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  27.22 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  27.01 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  25 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0072  cytochrome B561  25.64 
 
 		 196 aa  52  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  26.67 
 
 		 188 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  26.67 
 
 		 188 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  26.67 
 
 		 188 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  26.67 
 
 		 188 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  26.67 
 
 		 188 aa  51.6  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1049  cytochrome B561  27.6 
 
 		 410 aa  51.6  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.183438  normal  0.102385 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  26.67 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  26.67 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  26.67 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0686  cytochrome b561  30.94 
 
 		 188 aa  51.2  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  25.7 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  26.4 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  26.23 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  29.1 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2876  cytochrome B561  26.4 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.379711  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  24.26 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  28.65 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  24.57 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  24.31 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  25.7 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  24.31 
 
 		 182 aa  48.9  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  27.37 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0932  cytochrome b561 family protein  27.84 
 
 		 173 aa  48.9  0.00004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2432  cytochrome B561  27.08 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  25.41 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  29.1 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  24.04 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  25 
 
 		 183 aa  48.1  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  26.97 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  24 
 
 		 186 aa  47.8  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1216  cytochrome b561  23.5 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000559854  normal  0.299312 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1316  cytochrome B561  27.22 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171547  normal  0.725201 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7458  cytochrome B561  28 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  30.34 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  24.43 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  26.44 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  26.34 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  25.14 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  24.02 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  29.93 
 
 		 187 aa  45.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1464  cytochrome B561  29.51 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  25.28 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  24.16 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  24.73 
 
 		 406 aa  45.1  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  22.95 
 
 		 186 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26070  hypothetical protein  27.89 
 
 		 193 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.702919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  23.89 
 
 		 183 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  23.81 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  21.43 
 
 		 175 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1400  cytochrome B561  21.39 
 
 		 397 aa  44.7  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  23.78 
 
 		 183 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  24.18 
 
 		 186 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2215  hypothetical protein  25 
 
 		 190 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.511005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  24.31 
 
 		 186 aa  44.3  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  24.31 
 
 		 186 aa  44.3  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  25.26 
 
 		 203 aa  44.3  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  29.67 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  24.59 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  24.02 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4505  cytochrome B561  34.83 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.265021 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1254  hypothetical protein  25.57 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.73358 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2031  YceJ  24.43 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  22.35 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  25 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3088  cytochrome B561  25.7 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76146  normal  0.0516175 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1404  cytochrome B561  26.86 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.610566  normal  0.317054 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  22.86 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3871  putative cytochrome b561  26.67 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2226  hypothetical protein  27.75 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  23.33 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  23.89 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1084  cytochrome b561 family protein  25.14 
 
 		 177 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148515  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03240  cytochrome b561  24.73 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4373  cytochrome B561  33.71 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.454062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1269  hypothetical protein  24.43 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  25 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  24.57 
 
 		 196 aa  42.4  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>