More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0057 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0057  putative membrane associated response regulator  100 
 
 		 741 aa  1511    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02212  Signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 		 1054 aa  97.1  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  27.31 
 
 		 1014 aa  96.3  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.34 
 
 		 899 aa  95.9  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.618287  normal  0.57938 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003637  hypothetical protein  39.13 
 
 		 1055 aa  94.4  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  27.9 
 
 		 765 aa  94.4  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  35.29 
 
 		 631 aa  94  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  36.5 
 
 		 968 aa  94  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2107  hypothetical protein  37.4 
 
 		 676 aa  92.4  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  33.58 
 
 		 727 aa  90.9  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2687  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.88 
 
 		 784 aa  90.9  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.762737  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  32.09 
 
 		 925 aa  90.5  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  34.65 
 
 		 785 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  33.06 
 
 		 925 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4809  response regulator receiver protein  34.33 
 
 		 134 aa  90.5  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0053  membrane associated response regulator,histidine kinase  24.13 
 
 		 818 aa  90.1  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.255701  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3332  sensor histidine kinase/response regulator  39.13 
 
 		 819 aa  89.7  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  37.09 
 
 		 1297 aa  89  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 606 aa  88.2  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  34.4 
 
 		 785 aa  87.8  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1360  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 		 644 aa  87.8  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.528402  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.22 
 
 		 835 aa  87.8  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07851  hybrid sensory kinase  42.61 
 
 		 730 aa  87.8  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  34.4 
 
 		 785 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  32.23 
 
 		 1177 aa  87  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3706  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 738 aa  87  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03340  protein-histidine kinase, putative  37.5 
 
 		 1390 aa  86.3  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.205996  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3174  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 1087 aa  86.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134389 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 782 aa  86.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.7 
 
 		 1442 aa  86.7  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1012  response regulator, histidine kinase  40.17 
 
 		 578 aa  86.3  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 		 947 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2938  two component signal transduction response regulator  35.16 
 
 		 409 aa  85.5  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.03674e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1484  histidine kinase  32.61 
 
 		 785 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 812 aa  85.1  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 973 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  35.54 
 
 		 847 aa  84.3  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 		 1118 aa  84  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.86 
 
 		 873 aa  84  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 		 863 aa  83.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2833  histidine kinase  35.9 
 
 		 576 aa  84  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535084 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.23 
 
 		 852 aa  84  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2331  sensor histidine kinase/response regulator  35.43 
 
 		 779 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3979  histidine kinase  33.1 
 
 		 778 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.405731  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2375  histidine kinase  38.28 
 
 		 806 aa  84  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.824997  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.98 
 
 		 695 aa  83.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2664  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 		 662 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373594  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0522  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 125 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  33.88 
 
 		 977 aa  82.8  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  33.07 
 
 		 738 aa  83.2  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2754  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 		 1275 aa  82.8  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.727357 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  34.43 
 
 		 1023 aa  83.2  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1617  Signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 644 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 		 902 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0537  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 125 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 1202 aa  83.2  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0585  ATP-binding region ATPase domain protein  37.82 
 
 		 528 aa  82.4  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.215545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 993 aa  82.4  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 921 aa  82.4  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 		 833 aa  82  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.37 
 
 		 781 aa  82.4  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  34.33 
 
 		 2303 aa  82.4  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 		 601 aa  82.4  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 		 653 aa  82.4  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2370  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 		 899 aa  82  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.382891  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003159  probable sensor/response regulator hybrid  35.59 
 
 		 566 aa  82.4  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 968 aa  82.4  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0307  response regulator, histidine kinase  33.06 
 
 		 755 aa  82  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4576  histidine kinase  37.01 
 
 		 678 aa  82  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.354871 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  34.51 
 
 		 764 aa  81.6  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  35.25 
 
 		 1346 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02280  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  37.29 
 
 		 509 aa  81.6  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1943  histidine kinase  38.14 
 
 		 647 aa  81.6  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.539019  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2675  sensor histidine kinase/response regulator  35.85 
 
 		 651 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 		 631 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27550  putative sensor/response regulator hybrid  33.59 
 
 		 786 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922112 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  35.2 
 
 		 735 aa  80.9  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.28 
 
 		 922 aa  80.9  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1639  response regulator/sensor histidine kinase  34.23 
 
 		 693 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0878  sensor histidine kinase/response regulator  34.91 
 
 		 654 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599003  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1546  histidine kinase  34.75 
 
 		 545 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000544  hypothetical protein  35.1 
 
 		 828 aa  80.5  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1402  sensor histidine kinase/response regulator  34.91 
 
 		 654 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1795  sensor histidine kinase/response regulator  34.23 
 
 		 654 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0244  two component system histidine kinase  37.5 
 
 		 657 aa  80.1  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0288  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1141 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1002 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0474  sensor histidine kinase/response regulator  34.91 
 
 		 639 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0067  signal transduction histidine kinase-like protein protein  32.8 
 
 		 1021 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 		 1126 aa  80.1  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1002 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1954  PAS/histidine kinase/ATPase domain-containing protein  37.5 
 
 		 657 aa  80.1  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0684  sensor histidine kinase/response regulator  34.91 
 
 		 654 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439765  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.14 
 
 		 763 aa  80.1  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 705 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 765 aa  80.5  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 		 816 aa  80.1  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 		 817 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 909 aa  79.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0497  putative PAS/PAC sensor protein  33.05 
 
 		 574 aa  79.7  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.710767  normal  0.476938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>