More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1903 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1903  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 335 aa  687    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.107963  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3015  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 336 aa  143  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.947427  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0523  helix-turn-helix domain-containing protein  24.77 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4573  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2761  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2470  transcriptional regulator, AraC family  21.18 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0269  AraC family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2143  transcriptional regulator, AraC family  20.18 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.883029 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1288  transcriptional regulator, AraC family  25.81 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2682  transcriptional regulator, AraC family  27.37 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6972  hypothetical protein  22.92 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4184  helix-turn-helix domain-containing protein  42.11 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26598  normal  0.842889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0045  helix-turn-helix domain-containing protein  25.22 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  23.21 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1103  transcriptional regulator, AraC family  37.25 
 
 		 331 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0421  AraC family transcriptional regulator  21.32 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2361  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4594  helix-turn-helix domain-containing protein  40.96 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.359709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  24.32 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5752  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 364 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2047  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 350 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2601  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0251856 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1286  transcriptional regulator, AraC family  23.93 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  31.54 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3895  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 105 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1582  AraC family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2036  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 105 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3659  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356023  normal  0.158074 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16370  Transcriptional regulator, AraC family  21.83 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1451  transcriptional regulator, AraC family  21.19 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.508698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  25.52 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1131  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.079056 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  39.02 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3227  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3907  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3278  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3216  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1284  helix-turn-helix domain-containing protein  33.03 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4375  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  36.9 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04940  Transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543435  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0043  helix-turn-helix domain-containing protein  23.62 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37400  AraC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0307932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2071  helix-turn-helix domain-containing protein  34.94 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3935  AraC family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1917  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0400  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3859  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0940  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  40.85 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  22.52 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7632  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 116 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3547  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4504  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0682247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1134  AraC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 369 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  21.6 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3372  transcriptional regulator, AraC family  33.71 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2068  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  35.23 
 
 		 347 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5444  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 341 aa  57  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4110  transcriptional regulator, AraC family  22.39 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0242  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3648  transcriptional regulator, AraC family protein  37.04 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3952  transcriptional regulator, AraC family  36.59 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  39.47 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0380  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0657  AraC family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5098  helix-turn-helix domain-containing protein  22.06 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109281  normal  0.521536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3387  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4693  helix-turn-helix domain-containing protein  22.75 
 
 		 350 aa  55.8  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.621446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3753  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 362 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4938  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2269  transcriptional regulator, AraC family  20.83 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3808  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1661  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000279685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6762  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 386 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5787  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001133  hypothetical protein  34.29 
 
 		 487 aa  55.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6030  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4913  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 348 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0530  helix-turn-helix domain-containing protein  25.67 
 
 		 354 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2426  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 105 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438029  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4068  transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 		 355 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0084  helix-turn-helix domain-containing protein  31.03 
 
 		 354 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3231  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 288 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>