90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1263 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  100 
 
 		 242 aa  466  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  58.62 
 
 		 242 aa  290  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  61.28 
 
 		 240 aa  290  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  61.64 
 
 		 240 aa  288  5.0000000000000004e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  62.67 
 
 		 240 aa  278  6e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  44.89 
 
 		 244 aa  198  6e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  43.35 
 
 		 243 aa  191  9e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  45.38 
 
 		 245 aa  191  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  41.63 
 
 		 247 aa  186  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  41.2 
 
 		 247 aa  182  6e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  40.77 
 
 		 247 aa  182  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  40.77 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  40.77 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  41.63 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  41.81 
 
 		 246 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  44.59 
 
 		 246 aa  175  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  41.2 
 
 		 247 aa  174  8e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  41.2 
 
 		 247 aa  174  8e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  44.98 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0620  hypothetical protein  45.49 
 
 		 244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  40.77 
 
 		 247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1706  hypothetical protein  42.08 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0821668  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  39.73 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  37.61 
 
 		 241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  32.74 
 
 		 238 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2275  hypothetical protein  38.38 
 
 		 235 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  32.86 
 
 		 241 aa  124  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1919  hypothetical protein  31.56 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  33.9 
 
 		 236 aa  121  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  32.27 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1019  hypothetical protein  32.74 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.132736  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  32.82 
 
 		 261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5062  hypothetical protein  32.42 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0440  hypothetical protein  33.19 
 
 		 239 aa  103  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.871963  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  28.07 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1751  protein of unknown function DUF81  30.17 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4204  hypothetical protein  38.06 
 
 		 174 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2191  hypothetical protein  32.09 
 
 		 243 aa  92.8  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.496448 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3303  hypothetical protein  29.58 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2292  hypothetical protein  33.49 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353248  normal  0.347992 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  30.04 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3844  hypothetical protein  29.57 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  25.89 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  25.52 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  25.1 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  26.38 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  25.11 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  29.31 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  24.43 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  25.45 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1175  protein of unknown function DUF81  23.38 
 
 		 257 aa  52.4  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.358804  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4518  hypothetical protein  28.74 
 
 		 255 aa  52  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.535232 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  32.39 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1737  hypothetical protein  23.48 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593381  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1995  hypothetical protein  27.65 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  25.82 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5048  protein of unknown function DUF81  28.4 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  30.66 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1794  hypothetical protein  23.48 
 
 		 241 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  25.81 
 
 		 254 aa  49.3  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  25.5 
 
 		 291 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1716  hypothetical protein  23.91 
 
 		 241 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  25.5 
 
 		 291 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  25.5 
 
 		 291 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0506  hypothetical protein  32.05 
 
 		 244 aa  49.3  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0953317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1495  membrane protein  23.48 
 
 		 241 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1504  membrane protein  23.91 
 
 		 241 aa  48.9  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1649  hypothetical protein  23.89 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1530  hypothetical protein  23.89 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  26.34 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2549  protein of unknown function DUF81  23.25 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.491339 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  24.68 
 
 		 297 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4367  protein of unknown function DUF81  29.07 
 
 		 253 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.688319 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  27.4 
 
 		 255 aa  45.4  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1535  hypothetical protein  24.31 
 
 		 241 aa  45.4  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.671723  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03786  putative integral membrane protein  30.4 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2506  hypothetical protein  26.4 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000601102  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  23.61 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  23.61 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0367  hypothetical protein  27.16 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0391  hypothetical protein  27.16 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.329397  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5307  protein of unknown function DUF81  23.73 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22320  protein of unknown function DUF81  24.31 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6207  hypothetical protein  27.57 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.449503  normal  0.698789 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1616  hypothetical protein  26.64 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  25.86 
 
 		 291 aa  42.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  22.81 
 
 		 248 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4839  hypothetical protein  23.68 
 
 		 249 aa  42.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.21149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1879  hypothetical protein  22.12 
 
 		 243 aa  42  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.518881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  29.61 
 
 		 240 aa  42  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.333988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>