270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04795 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04795  chaperone PapD  100 
 
 		 239 aa  488  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0824  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.36 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0615  chaperone protein PapD  35.62 
 
 		 239 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2919  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.61 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.264872  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4674  pili assembly chaperone  33.05 
 
 		 250 aa  140  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0251  fimbrial chaperone protein  34.62 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0319296  hitchhiker  0.0000992715 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0216  chaperone protein PapD  35.54 
 
 		 250 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000206765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0696  pili assembly chaperone  34.62 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0234  chaperone protein PapD  35.54 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0011245  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2495  fimbrial chaperone protein  35.34 
 
 		 250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0727302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0218  chaperone protein PapD  35 
 
 		 250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000225767  normal  0.548646 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0233  chaperone protein PapD  35.12 
 
 		 250 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0634  periplasmic pilus chaperone family protein  32.31 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0743  periplasmic pilus chaperone family protein  32.31 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4145  pili assembly chaperone  32.92 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4722  pili assembly chaperone  35 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.570892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0765  periplasmic pilus chaperone family protein  32.31 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00677  predicted assembly protein  32.47 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1610  pili assembly chaperone  31.25 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2938  pili assembly chaperone  31.88 
 
 		 243 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1628  pili assembly chaperone  32.11 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254202  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1148  pili assembly chaperone  32.11 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261386  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1525  pili assembly chaperone  30.87 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0404  pili assembly chaperone  32.31 
 
 		 255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0053  pili assembly chaperone  32.46 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1603  pili assembly chaperone  32.11 
 
 		 248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640544  normal  0.23965 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4105  pili assembly chaperone protein  32.61 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1548  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.87 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264488  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4164  pili assembly chaperone protein  32.61 
 
 		 242 aa  132  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00562333 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1058  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.29 
 
 		 249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1316  pili assembly chaperone  31.65 
 
 		 250 aa  132  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2488  periplasmic pilus chaperone family protein  31.65 
 
 		 250 aa  132  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00666  hypothetical protein  32.13 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3173  chaperone protein PapD  31.78 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.315924 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3479  chaperone protein PapD  30.93 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3154  chaperone protein PapD  31.78 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.190535 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3090  chaperone protein PapD  31.78 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3271  chaperone protein PapD  31.78 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.685151  normal  0.0204539 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1320  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.42 
 
 		 250 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4773  pili assembly chaperone  32.11 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.352818 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2631  periplasmic pilus chaperone family protein  32.3 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2716  fimbrial chaperone protein  32.07 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.435606  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2062  hypothetical protein  33.49 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1898  fimbrial chaperone yfcS precursor  33.49 
 
 		 249 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1911  fimbrial chaperone yfcS precursor  33.49 
 
 		 249 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.595232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1653  P pilus assembly protein, chaperone PapD  33.49 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0315  fimbrial chaperone  33.49 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.120821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0845  MrpD  33.49 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.788087  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02261  predicted periplasmic pilus chaperone  30.73 
 
 		 250 aa  122  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0807  periplasmic pilus chaperone family protein  30.13 
 
 		 243 aa  122  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.48 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  30.97 
 
 		 249 aa  119  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  32.91 
 
 		 241 aa  118  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02221  hypothetical protein  31.1 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  33.9 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  32.2 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  32.48 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  32.48 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.05 
 
 		 266 aa  112  6e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3183  chaperone protein PapD  29.51 
 
 		 247 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3246  pili assembly chaperone protein  29.51 
 
 		 247 aa  111  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150608 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3197  pili assembly chaperone protein  29.51 
 
 		 247 aa  111  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  31.22 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3362  pili assembly chaperone protein  29.29 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0478294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3260  pili assembly chaperone protein  29.29 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3510  periplasmic pilus chaperone family protein  26.97 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  29.6 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0652  pili assembly chaperone  26.14 
 
 		 249 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02917  predicted periplasmic pilin chaperone  26.82 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0653  Pili assembly chaperone, N-terminal  26.82 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.19 
 
 		 244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02867  hypothetical protein  26.82 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.386418  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3223  periplasmic pilus chaperone family protein  26.14 
 
 		 249 aa  109  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000604612  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  29.66 
 
 		 243 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  31.05 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  30.57 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  31.76 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2038  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  31.39 
 
 		 248 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361686  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  30.7 
 
 		 246 aa  105  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  33.03 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  28.95 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.68 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2229  chaperone protein PapD  33.04 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  28.95 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  29.79 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  28.95 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  33.48 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  33.48 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1500  pili assembly chaperone  31.25 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  28.95 
 
 		 309 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  33.48 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  30.41 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  29.54 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  28.95 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  31.31 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  31.31 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  33.33 
 
 		 232 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  31.31 
 
 		 227 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  29.74 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  31.82 
 
 		 248 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>