More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04749 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04749  transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  442  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0103  HTH-type transcriptional regulator, DeoR-family  68.81 
 
 		 251 aa  317  7e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2548  DeoR family transcriptional regulator  66.36 
 
 		 252 aa  295  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992878 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1493  DeoR family transcriptional regulator  56.44 
 
 		 254 aa  235  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0146  DeoR family transcriptional regulator  48.6 
 
 		 263 aa  224  9e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0131  DeoR family transcriptional regulator  48.6 
 
 		 263 aa  224  9e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2255  DeoR family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 256 aa  221  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2145  DeoR family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 256 aa  221  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0011  sugar metabolism transcriptional regulator  56.22 
 
 		 252 aa  221  6e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2128  DeoR family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 256 aa  221  6e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0175603 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0113  transcriptional regulator, DeoR family  50.23 
 
 		 253 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0119  transcriptional regulator, DeoR family  50.23 
 
 		 252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3069  transcriptional regulator, DeoR family  48.42 
 
 		 254 aa  214  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3108  DeoR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3228  DeoR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0605743 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3040  transcriptional regulator, DeoR family  48.85 
 
 		 254 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  49.31 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  49.31 
 
 		 255 aa  208  6e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  49.31 
 
 		 255 aa  208  6e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  49.31 
 
 		 265 aa  207  8e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  49.31 
 
 		 265 aa  207  8e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  49.31 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  49.31 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2824  DeoR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2746  DeoR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.437292  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1460  DeoR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585922  normal  0.541781 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0907  DeoR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 274 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0778  transcriptional regulator, DeoR family  44.13 
 
 		 256 aa  174  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4814  regulatory protein, DeoR  44.72 
 
 		 274 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0362  transcriptional regulator, DeoR family  44.22 
 
 		 260 aa  168  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2335  transcriptional regulator, DeoR family  43.14 
 
 		 268 aa  151  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0880169  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0922  DeoR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.519346  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3534  transcriptional regulator, DeoR family  39.81 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3732  transcriptional regulator, DeoR family  37.44 
 
 		 283 aa  135  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3115  DeoR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  hitchhiker  0.000781627 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0650  transcriptional regulator, DeoR family  39.71 
 
 		 276 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3701  transcriptional regulator, DeoR family  39.35 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0183  DeoR-family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 255 aa  131  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.341023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0180  DeoR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0693  transcriptional regulator, DeoR family  37.8 
 
 		 269 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0188  DeoR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0179  DeoR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0196  DeoR-family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.841984  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  36.63 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  40 
 
 		 254 aa  119  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 259 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  31.8 
 
 		 257 aa  108  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  37.68 
 
 		 255 aa  108  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0244  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.82 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0910  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.82 
 
 		 278 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2702  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.82 
 
 		 278 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2375  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.82 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0729  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.82 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0743  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.82 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2456  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.82 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0561581  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  36.36 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 259 aa  106  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  31.68 
 
 		 260 aa  105  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  30.63 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0603  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.36 
 
 		 278 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4870  DeoR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 288 aa  104  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.69583 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4407  DeoR family regulatory protein  32.02 
 
 		 252 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.144995 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4606  DeoR family regulatory protein  32.02 
 
 		 252 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 247 aa  102  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4532  DeoR family regulatory protein  32.02 
 
 		 252 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2220  DeoR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244246 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 254 aa  101  9e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  28.57 
 
 		 259 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 253 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3729  transcriptional regulator, DeoR family  31.75 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3316  transcriptional regulator, DeoR family  31.82 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.645793 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2109  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  32.72 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0643  DeoR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 259 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.933913  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  32.02 
 
 		 256 aa  99.8  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0603  DeoR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 254 aa  99.4  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  31.16 
 
 		 255 aa  99.4  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0423  DeoR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 259 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  28.36 
 
 		 248 aa  99  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  28.77 
 
 		 253 aa  98.6  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0383  DeoR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 254 aa  98.6  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  30.88 
 
 		 257 aa  98.2  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4660  DeoR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 260 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  31.34 
 
 		 253 aa  97.4  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  31.94 
 
 		 253 aa  97.4  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  32.27 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  29.03 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2377  DeoR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 253 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  31.51 
 
 		 253 aa  96.3  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 253 aa  96.3  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0623  DeoR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 294 aa  95.9  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2323  DeoR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 254 aa  96.3  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387167  normal  0.710388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>