88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_1006 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_1006  lactonizing lipase  100 
 
 
339 aa  692    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003806  lipase precursor  75.56 
 
 
309 aa  465  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02696  hypothetical protein  74.92 
 
 
353 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2564  triacylglycerol lipase  60.25 
 
 
317 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0164758  hitchhiker  0.00000000000783702 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3358  triacylglycerol lipase  66.55 
 
 
305 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27100  lactonizing lipase precursor  63.03 
 
 
311 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2292  lactonizing lipase precursor  63.03 
 
 
311 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4189  triacylglycerol lipase  66.32 
 
 
318 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3849  alpha/beta hydrolase fold  59.08 
 
 
323 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1098  alpha/beta hydrolase fold  59.57 
 
 
305 aa  345  6e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3176  alpha/beta hydrolase fold  58.21 
 
 
305 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.769561  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  55.48 
 
 
309 aa  326  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00660  putative lactonizing lipase  52.1 
 
 
324 aa  305  6e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5359  lipase  51.76 
 
 
309 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0298655  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1763  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  53.24 
 
 
308 aa  285  9e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0443  alpha/beta hydrolase fold  47.92 
 
 
351 aa  271  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0968  alpha/beta hydrolase fold  43.52 
 
 
364 aa  239  5.999999999999999e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000064595 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  45.36 
 
 
332 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  45.7 
 
 
332 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  45.07 
 
 
289 aa  223  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1144  alpha/beta hydrolase fold  43.38 
 
 
359 aa  222  6e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0571  Alpha/beta hydrolase fold  45.39 
 
 
296 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.819443  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  43.45 
 
 
294 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  45.37 
 
 
364 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  45.2 
 
 
364 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  43.96 
 
 
364 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  43.96 
 
 
364 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  43.96 
 
 
364 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  43.65 
 
 
364 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  43.21 
 
 
364 aa  209  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4646  alpha/beta hydrolase fold  45.7 
 
 
296 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.059951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4911  alpha/beta hydrolase fold  43.99 
 
 
296 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130947 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4854  alpha/beta hydrolase fold  43.09 
 
 
315 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0143781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4732  alpha/beta hydrolase fold  43.99 
 
 
296 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017589 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  44.27 
 
 
364 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  44.27 
 
 
360 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  44.27 
 
 
360 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  42.24 
 
 
367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  43.34 
 
 
364 aa  195  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  41.8 
 
 
367 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  41.8 
 
 
367 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  41.8 
 
 
367 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  41.8 
 
 
367 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  41.8 
 
 
367 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  41.8 
 
 
367 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  41.8 
 
 
367 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0462  alpha/beta hydrolase fold  38.96 
 
 
377 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.030432  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  42.51 
 
 
365 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  40.37 
 
 
377 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  42.66 
 
 
341 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0360  alpha/beta fold family hydrolase  30.29 
 
 
299 aa  100  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0949  PGAP1 family protein  32.92 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000633482  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01450  triacylglycerol lipase, putative  28.43 
 
 
561 aa  72.4  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.686849  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.24 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4120  hypothetical protein  29.29 
 
 
357 aa  66.2  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0106157 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6671  putative lipase  34.15 
 
 
367 aa  65.9  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09106  triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02040)  26.94 
 
 
394 aa  60.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0018  lipase, putative  24.93 
 
 
681 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2579  putative lipase  27.38 
 
 
413 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5996  hypothetical protein  26.75 
 
 
374 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2663  putative lipase  27.98 
 
 
413 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00815188  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2625  lipase, putative  27.98 
 
 
413 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0056265  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2353  lipase  27.98 
 
 
413 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2387  lipase (triacylglycerol lipase)  27.38 
 
 
413 aa  49.7  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.222994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2432  lipase  27.38 
 
 
400 aa  49.7  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0455376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2624  putative lipase  27.38 
 
 
413 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000276049 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2527  lipase, putative  26.92 
 
 
413 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2744  putative lipase  27.54 
 
 
413 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  0.00000452649 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2751  triacylglycerol lipase  23.21 
 
 
681 aa  47  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2694  triacylglycerol lipase  23.21 
 
 
681 aa  47  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  33.91 
 
 
281 aa  47  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.48 
 
 
313 aa  46.2  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0873  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.87 
 
 
273 aa  46.2  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00991005  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  28.57 
 
 
280 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2388  lipase  23.69 
 
 
643 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  34.65 
 
 
262 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  34.07 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4243  lipase, putative  34.45 
 
 
473 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.48059 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1065  PGAP1 family protein  33 
 
 
281 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  35.65 
 
 
294 aa  43.9  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  32.97 
 
 
286 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3012  lipase class 2  37.93 
 
 
314 aa  43.9  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0310  triacylglycerol lipase  25.31 
 
 
645 aa  43.5  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0303  triacylglycerol lipase  25.31 
 
 
645 aa  43.5  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0349  hypothetical protein  34.62 
 
 
264 aa  43.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  33.77 
 
 
286 aa  42.7  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  31.75 
 
 
282 aa  42.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 
274 aa  42.7  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>