132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2588 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  100 
 
 		 819 aa  1667    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  54.35 
 
 		 839 aa  870    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  54.47 
 
 		 833 aa  869    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  49.45 
 
 		 823 aa  803    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29300  Beta-mannosidase precursor (Mannanase)  40.39 
 
 		 847 aa  620  1e-176  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  40.54 
 
 		 837 aa  595  1e-168  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43820  Glycoside hydrolase family 2 (Mannanase, beta-galactosidase)  38.01 
 
 		 838 aa  568  1e-160  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.893374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  39.17 
 
 		 813 aa  537  1e-151  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  35.83 
 
 		 845 aa  493  9.999999999999999e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.63 
 
 		 845 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  33.69 
 
 		 837 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  36.34 
 
 		 875 aa  459  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.12 
 
 		 835 aa  459  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  35.09 
 
 		 864 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.72 
 
 		 813 aa  451  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  34.75 
 
 		 786 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  34.96 
 
 		 785 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.86 
 
 		 842 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  32.91 
 
 		 793 aa  430  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  38.15 
 
 		 840 aa  428  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  32.91 
 
 		 860 aa  421  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  34.92 
 
 		 897 aa  416  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  33.45 
 
 		 891 aa  412  1e-113  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.77 
 
 		 872 aa  411  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  33.45 
 
 		 891 aa  409  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  39.21 
 
 		 817 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  39.38 
 
 		 818 aa  406  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  32 
 
 		 871 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  35.29 
 
 		 824 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  33.25 
 
 		 861 aa  391  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  36.47 
 
 		 829 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  31.54 
 
 		 863 aa  388  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5307  Beta-mannosidase  40.66 
 
 		 799 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  35.16 
 
 		 812 aa  389  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  32.35 
 
 		 819 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  32.83 
 
 		 819 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000658  beta-mannosidase  31.03 
 
 		 802 aa  364  4e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  32.71 
 
 		 815 aa  362  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  36.06 
 
 		 831 aa  362  2e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  36.97 
 
 		 843 aa  358  1.9999999999999998e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  32.09 
 
 		 824 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0268  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  36.35 
 
 		 843 aa  354  4e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.617215  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  34.78 
 
 		 846 aa  353  8e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  34.03 
 
 		 880 aa  352  2e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06535  hypothetical protein  30.96 
 
 		 802 aa  345  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01742  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  26.45 
 
 		 940 aa  253  8.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.875366  normal  0.643329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2713  glycoside hydrolase family protein  38.27 
 
 		 663 aa  250  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0942684  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4121  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.76 
 
 		 826 aa  228  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  25.44 
 
 		 845 aa  224  6e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0169  mannosidase  27.54 
 
 		 821 aa  221  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0528  beta-mannosidase-related protein  30.23 
 
 		 839 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3792  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.64 
 
 		 826 aa  221  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0039  beta-mannosidase-related protein  30.89 
 
 		 839 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0815  glycosyl hydrolase family protein  30.89 
 
 		 839 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2885  beta-mannosidase-related protein  30.89 
 
 		 839 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2200  beta-mannosidase-related protein  30.89 
 
 		 839 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0638  glycosy hydrolase family protein  30.29 
 
 		 839 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0652  glycosy hydrolase family protein  30.89 
 
 		 839 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2507  beta-mannosidase-related protein  30.89 
 
 		 839 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365324  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6019  mannosidase  27.1 
 
 		 820 aa  198  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  28.85 
 
 		 763 aa  194  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1715  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  28.35 
 
 		 882 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2529  Beta-mannosidase  27.84 
 
 		 882 aa  194  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.869345  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5363  glycoside hydrolase family protein  28.25 
 
 		 853 aa  188  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1473  glycoside hydrolase family protein  29.22 
 
 		 816 aa  187  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1808  Beta-mannosidase  27.41 
 
 		 816 aa  180  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4156  Beta-mannosidase  27.89 
 
 		 828 aa  179  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4210  Beta-mannosidase  27.89 
 
 		 828 aa  179  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3307  Beta-mannosidase  27.89 
 
 		 828 aa  179  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3633  Beta-mannosidase  27.32 
 
 		 827 aa  171  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4395  beta-mannosidase  27.44 
 
 		 825 aa  167  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  25.97 
 
 		 962 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4107  beta-mannosidase  28.19 
 
 		 812 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5840  beta-mannosidase  27.71 
 
 		 856 aa  157  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0188  Beta-mannosidase  28.49 
 
 		 811 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.8 
 
 		 878 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.03 
 
 		 971 aa  145  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  23.85 
 
 		 1144 aa  143  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.53 
 
 		 744 aa  143  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.71 
 
 		 984 aa  132  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  24.29 
 
 		 734 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1074  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  25.67 
 
 		 815 aa  115  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822131  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  22.22 
 
 		 906 aa  115  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  26.26 
 
 		 724 aa  114  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.83 
 
 		 720 aa  107  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 		 739 aa  106  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  25 
 
 		 1362 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.62 
 
 		 614 aa  68.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25 
 
 		 923 aa  68.2  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  23.2 
 
 		 1024 aa  67  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3078  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.15 
 
 		 609 aa  65.5  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  22.73 
 
 		 1036 aa  61.6  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.61 
 
 		 799 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  24.23 
 
 		 564 aa  56.6  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  22 
 
 		 640 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2707  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.41 
 
 		 624 aa  55.1  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  24.87 
 
 		 563 aa  53.9  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  23.51 
 
 		 945 aa  53.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.71 
 
 		 623 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  19.89 
 
 		 884 aa  52  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>