More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2579 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2579  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 245 aa  478  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.763901  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0438  ABC-2 type transporter  71.43 
 
 		 245 aa  320  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3012  ABC-2 type transporter  67.35 
 
 		 245 aa  317  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  33.89 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  33.48 
 
 		 241 aa  125  7e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  33.48 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5571  ABC-2 type transporter  33.49 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00648583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3633  ABC-2 type transporter  36.59 
 
 		 241 aa  99.4  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2394  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  31.11 
 
 		 252 aa  96.3  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.220464  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  31.1 
 
 		 339 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0418  ABC-2 type transporter  30.62 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  31.22 
 
 		 245 aa  94.4  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2507  putative ABC transporter, permease protein  31.21 
 
 		 339 aa  94  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  30.49 
 
 		 339 aa  94  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22030  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.56 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0900218 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  30.49 
 
 		 339 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  30.49 
 
 		 339 aa  93.2  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  31.1 
 
 		 339 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0259  ABC transporter  32.45 
 
 		 365 aa  92  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.474488  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2352  ABC-2 type transporter  31.21 
 
 		 339 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.229577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  29.88 
 
 		 339 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  29.88 
 
 		 339 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3297  multidrug ABC transporter inner membrane protein  31.07 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.790458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3178  multidrug ABC transporter inner membrane protein  33.33 
 
 		 251 aa  89.4  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.458252 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1669  ABC-2 type transporter  32.58 
 
 		 347 aa  87  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 378 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0017  ABC transporter, permease protein  30.51 
 
 		 376 aa  86.7  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0737  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.71 
 
 		 377 aa  86.3  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00484474  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0577  ABC-2 type transporter  29.49 
 
 		 247 aa  85.1  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  28.65 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  27.17 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2281  ABC transporter, permease  29.56 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11702  ABC-2 type transport system permease protein  28.51 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.342622 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1758  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3403  multidrug ABC transporter inner membrane protein  31.7 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2643  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  32.73 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0258  ABC transporter permease  31.4 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  30.6 
 
 		 373 aa  75.9  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  29.74 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.72 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2958  ABC transporter, DrrB efflux protein  31.94 
 
 		 226 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3002  multidrug ABC transporter inner membrane protein  31.94 
 
 		 226 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.377111 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2973  multidrug ABC transporter inner membrane protein  31.94 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  28.73 
 
 		 375 aa  72.4  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  23.03 
 
 		 384 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  24.16 
 
 		 387 aa  72  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  32.12 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  23.03 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.03 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  27.5 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  23.03 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5641  ABC-2 type transporter  30.11 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.350445 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1853  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  24.16 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  27.23 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.73 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2726  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  26.26 
 
 		 374 aa  69.3  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 		 372 aa  69.3  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2116  ABC-2 type transporter  33.56 
 
 		 338 aa  68.6  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.906215  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2927  ABC-2 type transporter  31.93 
 
 		 378 aa  68.6  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  27.62 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1368  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.20656  normal  0.169668 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  26.54 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 373 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  23.03 
 
 		 381 aa  67  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  28.14 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  26.76 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  25.76 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  23.73 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  26.76 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  25.76 
 
 		 368 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  25.76 
 
 		 368 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  25.76 
 
 		 368 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  25.76 
 
 		 368 aa  65.9  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  25.76 
 
 		 368 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  25.76 
 
 		 368 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  25.76 
 
 		 368 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 366 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  25.76 
 
 		 368 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  25.76 
 
 		 368 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  25.76 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  25.76 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  25.76 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  28.73 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  25.76 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  26.76 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  26.76 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  29.48 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  26.76 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  27.37 
 
 		 691 aa  63.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  26.76 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  26.57 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>