More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2378 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 415 aa  796    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1447  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 432 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674302  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  27.54 
 
 		 370 aa  102  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  27.7 
 
 		 409 aa  97.4  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 415 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 390 aa  94  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 392 aa  93.6  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 395 aa  91.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 387 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.07 
 
 		 388 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.07 
 
 		 388 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  25.51 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  24.62 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3885  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37466  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  21.91 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  22.7 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3161  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 442 aa  78.6  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.586334 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  24.55 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1619  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00015243  normal  0.333311 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  28.68 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4126  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.641769 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4035  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  25.82 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  25.61 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  22.19 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  24.25 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  22.25 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  23.99 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2988  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000335031  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  23.99 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  26.14 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  23.9 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  24.33 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3232  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 395 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.904986 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  22.76 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1575  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000133383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  22.04 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  32.23 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  25.23 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  21.99 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  24.09 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  29.94 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1704  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.013195 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  24.09 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  25 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  33.72 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  24.09 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  24.09 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  22.31 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  22.73 
 
 		 424 aa  69.7  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  24.39 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 439 aa  69.7  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  23 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 384 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 435 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  24.55 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  26.24 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  21.85 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1388  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012215  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 474 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  22.45 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0731  multidrug resistance protein B  22.25 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2302  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  23.43 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  22.25 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0628  major facilitator family transporter  23.71 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0574  major facilitator family transporter  23.71 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.84757 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  22.39 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0569  major facilitator family transporter  23.71 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.676652  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>