71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1704 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1704  major facilitator transporter  100 
 
 
339 aa  655    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.013195 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1575  major facilitator transporter  55.82 
 
 
378 aa  346  4e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000000133383 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1513  major facilitator transporter  60.38 
 
 
375 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.519208  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  29.88 
 
 
415 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  31.36 
 
 
403 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2146  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 
438 aa  54.3  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 
390 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  31.76 
 
 
391 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  31.25 
 
 
398 aa  53.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  23.49 
 
 
392 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4365  major facilitator transporter  31 
 
 
413 aa  50.1  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1894  major facilitator transporter  31.14 
 
 
431 aa  49.7  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 
413 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 
389 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  30.67 
 
 
405 aa  48.1  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 
435 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  25.07 
 
 
410 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  29.79 
 
 
381 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  28.72 
 
 
381 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  28.72 
 
 
381 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  29.79 
 
 
381 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  29.13 
 
 
411 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1995  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
464 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230146  hitchhiker  0.000000379141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1657  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 
413 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.992815  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0650  major facilitator family transporter  22.97 
 
 
393 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407315  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  28.28 
 
 
400 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0928  multidrug resistance protein  28.28 
 
 
400 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  26.13 
 
 
387 aa  47  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 
387 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  26.55 
 
 
440 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0651  major facilitator family transporter  22.97 
 
 
393 aa  46.6  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  29.05 
 
 
404 aa  46.2  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  26.9 
 
 
421 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  23.65 
 
 
393 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  26.25 
 
 
407 aa  46.6  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01577  MFS lactose permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G01860)  26.11 
 
 
539 aa  46.2  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0938602 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  28.42 
 
 
407 aa  46.2  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0658  major facilitator transporter  22.97 
 
 
392 aa  46.2  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1716  major facilitator superfamily transporter  25.57 
 
 
413 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224446  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0731  multidrug resistance protein B  27.27 
 
 
400 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1625  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 
413 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0979521  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  26.97 
 
 
410 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2363  major facilitator transporter  28.21 
 
 
464 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.53 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.53 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  27.27 
 
 
400 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  27.66 
 
 
381 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  27.66 
 
 
384 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  28.72 
 
 
381 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  27.66 
 
 
381 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  23.98 
 
 
381 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  25.74 
 
 
387 aa  44.3  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  26.26 
 
 
400 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0424  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 
385 aa  44.3  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  23.82 
 
 
404 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  26.6 
 
 
399 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 
678 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  28.92 
 
 
444 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2352  major facilitator transporter  27.39 
 
 
460 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2468  major facilitator transporter  27.39 
 
 
460 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0361847  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2493  major facilitator superfamily transporter  30.66 
 
 
407 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 
415 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  24.49 
 
 
404 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0819  major facilitator family transporter  22.3 
 
 
393 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.23042e-52 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  36.73 
 
 
409 aa  42.7  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  24.49 
 
 
404 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  22.3 
 
 
393 aa  42.7  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  22.3 
 
 
393 aa  42.7  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  21.41 
 
 
419 aa  42.4  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  36.26 
 
 
412 aa  42.7  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>