68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1575 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1575  major facilitator transporter  100 
 
 		 378 aa  731    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000133383 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1704  major facilitator transporter  55.82 
 
 		 339 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.013195 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1513  major facilitator transporter  56.3 
 
 		 375 aa  328  8e-89  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.519208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  30.56 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  27.03 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26513  MFS family transporter: multidrug efflux  32.11 
 
 		 442 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0853382  normal  0.0548675 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  27.03 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  27.03 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 398 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  27.03 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0424  major facilitator superfamily MFS_1  37.21 
 
 		 385 aa  50.8  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  27.03 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  25.3 
 
 		 399 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 		 390 aa  49.7  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  38.61 
 
 		 407 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  26.94 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 414 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2815  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 421 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0033693  hitchhiker  0.00275134 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 429 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  26.58 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  26.13 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 412 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 391 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  37.5 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 389 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 416 aa  47  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 435 aa  46.6  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 444 aa  46.6  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  21.34 
 
 		 455 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 		 419 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0477  inner membrane transport protein YajR  29.14 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  29.14 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  31.03 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0475  inner membrane transport protein YajR  29.14 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0538  inner membrane transport protein YajR  29.14 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  29.27 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 456 aa  45.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0483  inner membrane transport protein YajR  29.14 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1894  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 431 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 436 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 		 436 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 404 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 		 457 aa  44.3  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  23.41 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 387 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1657  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 413 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.992815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1625  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 413 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0979521  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  26.7 
 
 		 440 aa  43.9  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 		 392 aa  43.5  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1716  major facilitator superfamily transporter  28.47 
 
 		 413 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 413 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 395 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 395 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2789  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 385 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 407 aa  43.1  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4365  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 413 aa  43.1  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 407 aa  43.1  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  24.28 
 
 		 411 aa  43.1  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2788  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.29 
 
 		 389 aa  43.1  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0332558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>