37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1447 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1447  major facilitator transporter  100 
 
 		 432 aa  847    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674302  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 415 aa  89.7  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  21.67 
 
 		 376 aa  53.5  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 		 393 aa  50.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2124  putative MFS-type transporter YdeE  23.72 
 
 		 395 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0942294  normal  0.976791 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1742  putative MFS-type transporter YdeE  23.08 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0931308  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01493  predicted transporter  23.08 
 
 		 395 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.045441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01504  hypothetical protein  23.08 
 
 		 395 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  25.66 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2148  putative MFS-type transporter YdeE  24.16 
 
 		 395 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  23.42 
 
 		 414 aa  47.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1630  putative MFS-type transporter YdeE  23.08 
 
 		 395 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0579751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 394 aa  47.4  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1623  putative MFS-type transporter YdeE  23.08 
 
 		 395 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000326131  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 396 aa  47  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  22.34 
 
 		 403 aa  47  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 396 aa  47  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 410 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0610  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.14 
 
 		 464 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.462732  normal  0.495513 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  22.4 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  20.51 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  22.61 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  32.06 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  22.61 
 
 		 506 aa  45.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  22.61 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  27.65 
 
 		 503 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  22.61 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2034  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3708  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2112  major facilitator superfamily MFS_1  22.44 
 
 		 395 aa  43.9  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000539855  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47900  putative MFS transporter  27.16 
 
 		 480 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00274323  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  22.61 
 
 		 506 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 394 aa  43.9  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  22.63 
 
 		 420 aa  43.9  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4129  MFS family transporter  26.54 
 
 		 480 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>