More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0877 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0877  Prephenate dehydratase  100 
 
 		 288 aa  600  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0495  Prephenate dehydratase  45.74 
 
 		 279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  45.94 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  46.72 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0656  Prephenate dehydratase  44.53 
 
 		 276 aa  226  3e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.416459  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2091  Chorismate mutase  44.8 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.746584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_3267  predicted protein  41.64 
 
 		 304 aa  223  4e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0474  Prephenate dehydratase  42.91 
 
 		 279 aa  219  3e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  42.55 
 
 		 358 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1567  prephenate dehydratase  40.96 
 
 		 271 aa  218  7e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1644  prephenate dehydratase  43.21 
 
 		 280 aa  218  7e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  42.18 
 
 		 358 aa  218  1e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  41.82 
 
 		 358 aa  216  4e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0180  prephenate dehydratase  42.05 
 
 		 283 aa  216  5e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0541  Prephenate dehydratase  41.99 
 
 		 279 aa  216  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0537  prephenate dehydratase  41.09 
 
 		 279 aa  215  7e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1881  prephenate dehydratase  43.22 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858484 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3724  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  42.09 
 
 		 632 aa  202  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0467  prephenate dehydratase  41.7 
 
 		 296 aa  201  8e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4217  prephenate dehydratase  40.44 
 
 		 280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.239434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7058  prephenate dehydratase  40.94 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  41.45 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1767  prephenate dehydratase  40.22 
 
 		 284 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  37.77 
 
 		 311 aa  195  8.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3538  prephenate dehydratase  39.49 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4087  prephenate dehydratase  39.11 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4403  prephenate dehydratase  40.81 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4083  prephenate dehydratase  40.07 
 
 		 284 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13638  predicted protein  41.87 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  40.79 
 
 		 364 aa  190  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2043  prephenate dehydratase  39.78 
 
 		 283 aa  190  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0653  prephenate dehydratase  42.28 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3732  prephenate dehydratase  39.71 
 
 		 286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.755175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3428  prephenate dehydratase  39.19 
 
 		 284 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  39.86 
 
 		 371 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0365  prephenate dehydratase  39.49 
 
 		 286 aa  189  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1620  prephenate dehydratase  38.97 
 
 		 284 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.65 
 
 		 393 aa  187  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2951  prephenate dehydratase  39.19 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  40.22 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  39.49 
 
 		 371 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0661  P-protein (includes: chorismate mutase and prephenate dehydratase)  35.59 
 
 		 391 aa  187  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.49 
 
 		 371 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  37.18 
 
 		 356 aa  186  5e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  39.71 
 
 		 365 aa  185  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  39.49 
 
 		 382 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  39.35 
 
 		 364 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  38.99 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  38.99 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0285  prephenate dehydratase  38.41 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.224737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  39.35 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  38.99 
 
 		 364 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  37.41 
 
 		 274 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1590  chorismate mutase  36.9 
 
 		 399 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  40.65 
 
 		 276 aa  182  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  38.99 
 
 		 364 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  37.91 
 
 		 356 aa  181  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  39.29 
 
 		 359 aa  181  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.99 
 
 		 364 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4688  prephenate dehydratase  40.66 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0153843  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1988  prephenate dehydratase  40.07 
 
 		 287 aa  180  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630591  normal  0.549246 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3912  Prephenate dehydratase  37.5 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  38.99 
 
 		 365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0524  prephenate dehydratase  41.33 
 
 		 277 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0734392  normal  0.460167 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  38.57 
 
 		 277 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  38.57 
 
 		 277 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0174  chorismate mutase  38.41 
 
 		 361 aa  177  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  38.13 
 
 		 374 aa  177  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3606  Prephenate dehydratase  38.83 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0170  prephenate dehydratase  40.48 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0642  prephenate dehydratase  38.55 
 
 		 287 aa  178  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  38.91 
 
 		 355 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01001  chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  35.74 
 
 		 392 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0018  prephenate dehydratase  37.68 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  40.58 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  41.2 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2361  prephenate dehydratase  40.59 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.814265  normal  0.327119 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  38.27 
 
 		 365 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1749  prephenate dehydratase  37.82 
 
 		 418 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2629  prephenate dehydratase  38.69 
 
 		 286 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  38.71 
 
 		 359 aa  176  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0706  prephenate dehydratase  40.22 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.146743  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  38.6 
 
 		 371 aa  176  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  38.13 
 
 		 374 aa  176  4e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  37.09 
 
 		 384 aa  176  5e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3518  prephenate dehydratase  37.99 
 
 		 310 aa  176  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  37.86 
 
 		 277 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  37.8 
 
 		 413 aa  175  7e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  38.49 
 
 		 280 aa  175  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  40.22 
 
 		 359 aa  175  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0105  prephenate dehydratase  39.04 
 
 		 265 aa  175  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1547  prephenate dehydratase  35.66 
 
 		 276 aa  175  9e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004398  chorismate mutase I/prephenate dehydratase  35.38 
 
 		 392 aa  175  9e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2809  prephenate dehydratase  37.96 
 
 		 372 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.433236  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0252  prephenate dehydratase  37.23 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  40.65 
 
 		 355 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0622  prephenate dehydratase  38.97 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.284363  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  36.76 
 
 		 385 aa  173  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.49 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1809  prephenate dehydratase  40.07 
 
 		 295 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.115737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>