More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0605 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
325 aa  665    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  89.54 
 
 
325 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1379  oxidoreductase-like protein  39.33 
 
 
362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0737  oxidoreductase domain-containing protein  31.88 
 
 
346 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65576  predicted protein  29.15 
 
 
348 aa  156  3e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11260  oxidoreductase domain protein  26.97 
 
 
349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.305619  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  31.27 
 
 
330 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07353  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16380)  29.09 
 
 
344 aa  122  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.550714 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05970  conserved hypothetical protein  29.61 
 
 
358 aa  122  6e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  30.25 
 
 
335 aa  115  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  28.75 
 
 
327 aa  112  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  31.14 
 
 
347 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48762  predicted protein  27.15 
 
 
416 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 
331 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  25.68 
 
 
327 aa  106  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0656  oxidoreductase domain-containing protein  28.23 
 
 
320 aa  103  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.174066  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  31.68 
 
 
388 aa  103  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.89 
 
 
346 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  27.01 
 
 
370 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  23.81 
 
 
324 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  27.68 
 
 
325 aa  99.8  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  26.2 
 
 
333 aa  99  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 
363 aa  98.6  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  25.38 
 
 
384 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  27.85 
 
 
330 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 
356 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  27.94 
 
 
330 aa  98.2  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  23.98 
 
 
350 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  29.46 
 
 
384 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  29.46 
 
 
384 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  27.41 
 
 
329 aa  96.7  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  23.98 
 
 
350 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  23.98 
 
 
350 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  41.3 
 
 
342 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  25.35 
 
 
346 aa  95.5  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  29.41 
 
 
329 aa  94.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04200  conserved hypothetical protein  26.33 
 
 
400 aa  94  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  30.56 
 
 
328 aa  94  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  27.71 
 
 
387 aa  94  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4981  oxidoreductase-like  26.39 
 
 
337 aa  94  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  27.74 
 
 
337 aa  93.6  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  31.84 
 
 
381 aa  93.6  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 
375 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  27.52 
 
 
321 aa  92  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  27.56 
 
 
328 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  27.27 
 
 
334 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  23.86 
 
 
322 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 
356 aa  90.9  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  28.82 
 
 
359 aa  90.1  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  26.1 
 
 
354 aa  90.1  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  24.39 
 
 
336 aa  89.7  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 
332 aa  89.7  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  24.05 
 
 
350 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  27.49 
 
 
374 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3470  oxidoreductase domain protein  27.11 
 
 
328 aa  89.4  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6269  oxidoreductase domain protein  24.7 
 
 
345 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  26.33 
 
 
356 aa  88.6  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  28.19 
 
 
337 aa  88.6  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  25.57 
 
 
396 aa  88.2  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  31.82 
 
 
346 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  27.19 
 
 
374 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  31.82 
 
 
346 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  26.73 
 
 
360 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  26.97 
 
 
337 aa  87  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  25.71 
 
 
360 aa  87  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  25.71 
 
 
360 aa  87  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  31.72 
 
 
347 aa  86.7  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0302  oxidoreductase domain protein  36.53 
 
 
393 aa  86.3  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00604537  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3819  oxidoreductase-like  22.22 
 
 
341 aa  85.9  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  25.07 
 
 
335 aa  85.9  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2941  oxidoreductase domain-containing protein  23.61 
 
 
324 aa  85.9  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 
359 aa  85.9  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  32.32 
 
 
338 aa  85.9  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  25.78 
 
 
369 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  26.45 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2322  oxidoreductase domain-containing protein  27.2 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.98 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  26.16 
 
 
399 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  29.32 
 
 
343 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3433  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 
363 aa  84.3  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.808299  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3062  oxidoreductase-like  26.11 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0932673  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  30.48 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.59 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.59 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  25.08 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 
344 aa  82.8  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  29.39 
 
 
340 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  25.41 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  26.85 
 
 
380 aa  82.4  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  28.62 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2245  oxidoreductase domain-containing protein  25.98 
 
 
342 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00745524  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.2 
 
 
343 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  26.86 
 
 
382 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.3 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  29.15 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  24.93 
 
 
356 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  26.15 
 
 
324 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  25.58 
 
 
331 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  25.38 
 
 
357 aa  82  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>