74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1815 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1815  signal-transduction protein  100 
 
 
375 aa  737    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0955331  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  26.18 
 
 
386 aa  97.1  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  22.99 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3545  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
411 aa  77.8  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  26.64 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1627  putative signal transduction protein with CBS domains  28.62 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.759399 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  30.97 
 
 
863 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  23.37 
 
 
384 aa  60.5  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  30.09 
 
 
863 aa  59.7  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1013  CBS domain containing membrane protein  21.88 
 
 
380 aa  59.7  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2156  CBS domain containing membrane protein  24.54 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  24.39 
 
 
258 aa  58.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0532  signal-transduction protein  25.81 
 
 
375 aa  57.8  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0376075 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  32.13 
 
 
688 aa  57.4  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  27.75 
 
 
280 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  26.44 
 
 
291 aa  54.3  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3809  putative signal transduction protein with CBS domains  23.23 
 
 
407 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  36.21 
 
 
145 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  23.81 
 
 
252 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  26.85 
 
 
845 aa  51.6  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0072  CBS domain containing membrane protein  23.08 
 
 
398 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  28.68 
 
 
907 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  28.97 
 
 
769 aa  50.8  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  24.26 
 
 
272 aa  50.4  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  20.66 
 
 
399 aa  50.4  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  26.36 
 
 
888 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  28.93 
 
 
865 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  25.41 
 
 
279 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  23.97 
 
 
413 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1489  CBS  26.97 
 
 
239 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  22.96 
 
 
877 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  23.68 
 
 
331 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2351  CBS domain-containing protein  29.17 
 
 
283 aa  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000984272  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  32.31 
 
 
688 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  30.7 
 
 
148 aa  47.4  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  24.14 
 
 
282 aa  47.8  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  23.66 
 
 
411 aa  47.4  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  27.86 
 
 
898 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  22.88 
 
 
413 aa  47  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  35.09 
 
 
688 aa  46.6  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.32 
 
 
873 aa  46.6  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2966  signal-transduction protein  33.33 
 
 
132 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01671  CBS domain protein  33.33 
 
 
104 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2082  signal-transduction protein  31 
 
 
125 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.077992 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  22.4 
 
 
412 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 
145 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 
145 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0535  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 
658 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.672261  normal  0.0583682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1426  MgtE integral membrane region  34.15 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  29.85 
 
 
640 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  32.71 
 
 
191 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 
145 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.17 
 
 
143 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  27.07 
 
 
909 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  28.36 
 
 
223 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0705  putative signal transduction protein with CBS domains  28.85 
 
 
124 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  30.39 
 
 
127 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  31.71 
 
 
158 aa  43.5  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  31.43 
 
 
139 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0410  putative CBS domain-containing signal transduction protein  29.59 
 
 
124 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269207  normal  0.258379 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0310  hypothetical protein  26.9 
 
 
284 aa  43.9  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  30.53 
 
 
146 aa  43.9  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  31.68 
 
 
139 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  29.2 
 
 
201 aa  43.5  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  31.48 
 
 
143 aa  43.5  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  24.68 
 
 
313 aa  43.1  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  29.93 
 
 
155 aa  43.1  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  28.46 
 
 
141 aa  42.7  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  25.2 
 
 
875 aa  42.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  29.41 
 
 
883 aa  43.1  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  30.19 
 
 
142 aa  42.7  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  27.59 
 
 
151 aa  43.1  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  26.27 
 
 
885 aa  42.7  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  27.19 
 
 
146 aa  42.7  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.278615 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>