More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1991 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1991  threonine dehydratase  100 
 
 		 439 aa  879    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.845373  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2783  threonine dehydratase  65.38 
 
 		 429 aa  560  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642474  normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2990  threonine dehydratase  67.87 
 
 		 457 aa  550  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3103  threonine dehydratase  63.36 
 
 		 426 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.832581 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3083  threonine dehydratase  63.36 
 
 		 426 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3143  threonine dehydratase  63.36 
 
 		 426 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449239  normal  0.1577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3634  threonine dehydratase  64.01 
 
 		 429 aa  533  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11591  threonine dehydratase  66.98 
 
 		 429 aa  512  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.032479999999999e-51  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5343  threonine dehydratase  62.17 
 
 		 420 aa  503  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3353  threonine dehydratase  57.86 
 
 		 431 aa  420  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0223363  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09210  threonine dehydratase  55.53 
 
 		 437 aa  409  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23350  threonine dehydratase  54.94 
 
 		 423 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0207  threonine dehydratase  45.73 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.743281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5911  threonine dehydratase  47.16 
 
 		 424 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  45.33 
 
 		 437 aa  382  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1906  threonine dehydratase  43.6 
 
 		 414 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1447  threonine dehydratase  45.39 
 
 		 420 aa  369  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.102012  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1711  threonine dehydratase  46.17 
 
 		 420 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3487  threonine dehydratase  45.26 
 
 		 420 aa  368  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1003  threonine dehydratase  46.36 
 
 		 415 aa  368  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000180707  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2586  threonine dehydratase  48.66 
 
 		 423 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1924  threonine dehydratase  43.55 
 
 		 418 aa  365  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14942  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1892  threonine dehydratase  45.02 
 
 		 420 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1584  threonine dehydratase  48.15 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000192202  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1718  threonine dehydratase  45.02 
 
 		 420 aa  365  1e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1855  threonine dehydratase  44.79 
 
 		 420 aa  365  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1854  threonine dehydratase  45.02 
 
 		 420 aa  365  1e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1695  threonine dehydratase  44.79 
 
 		 420 aa  363  3e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1970  threonine dehydratase  44.79 
 
 		 420 aa  363  4e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1938  threonine dehydratase  44.79 
 
 		 412 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1670  threonine dehydratase  44.79 
 
 		 420 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1673  threonine dehydratase  43.31 
 
 		 422 aa  361  1e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3429  threonine dehydratase  46.54 
 
 		 414 aa  359  7e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0204  threonine dehydratase  44.39 
 
 		 416 aa  358  8e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123725  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2098  threonine dehydratase  43.83 
 
 		 422 aa  347  3e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2135  threonine dehydratase  43.83 
 
 		 422 aa  347  3e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2872  threonine dehydratase  47 
 
 		 415 aa  333  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2649  threonine dehydratase  46.6 
 
 		 415 aa  330  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384184  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3473  threonine dehydratase  45.76 
 
 		 413 aa  323  4e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2496  threonine dehydratase  43.26 
 
 		 416 aa  323  6e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1597  threonine dehydratase  43.58 
 
 		 416 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1421  threonine dehydratase  44.97 
 
 		 416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.163936 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0497  threonine dehydratase  43.94 
 
 		 412 aa  298  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1956  threonine dehydratase  41.61 
 
 		 421 aa  298  2e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2885  threonine dehydratase  44.5 
 
 		 408 aa  297  3e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0069  threonine dehydratase  44.47 
 
 		 425 aa  290  4e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1421  threonine dehydratase  42.79 
 
 		 418 aa  289  7e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2138  threonine dehydratase  42.28 
 
 		 404 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134573  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1051  threonine dehydratase  41.12 
 
 		 408 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1373  threonine dehydratase  42.51 
 
 		 415 aa  263  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  40.82 
 
 		 507 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  37.89 
 
 		 501 aa  249  8e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  40.56 
 
 		 507 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  40.4 
 
 		 506 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  40.4 
 
 		 506 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  40.82 
 
 		 507 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3647  threonine dehydratase  38.82 
 
 		 516 aa  245  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  40.31 
 
 		 507 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  37.1 
 
 		 509 aa  241  1e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  37.72 
 
 		 507 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  36.12 
 
 		 514 aa  239  9e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1431  threonine dehydratase  38.33 
 
 		 509 aa  238  2e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0729808 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  36.5 
 
 		 507 aa  238  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  39.64 
 
 		 514 aa  237  3e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  38.56 
 
 		 526 aa  237  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  38.65 
 
 		 504 aa  237  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  38.65 
 
 		 504 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  35.84 
 
 		 511 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  35.84 
 
 		 511 aa  236  7e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  40.27 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  39.69 
 
 		 509 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  33.42 
 
 		 513 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0562  threonine dehydratase  41.07 
 
 		 507 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0284  threonine dehydratase  40.41 
 
 		 535 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  35.55 
 
 		 511 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1809  threonine dehydratase  40.15 
 
 		 535 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0549  threonine dehydratase  40 
 
 		 507 aa  229  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  38.18 
 
 		 501 aa  229  7e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0340  threonine dehydratase  38.1 
 
 		 506 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.432772 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  34.18 
 
 		 403 aa  229  1e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  39.2 
 
 		 504 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39224  predicted protein  38.14 
 
 		 510 aa  228  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0161526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  38.94 
 
 		 504 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  38.94 
 
 		 504 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0840  threonine dehydratase  39.35 
 
 		 507 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  35.94 
 
 		 503 aa  227  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2787  threonine dehydratase  39.9 
 
 		 507 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0181  threonine dehydratase  39.35 
 
 		 507 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  37.35 
 
 		 514 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2312  threonine dehydratase  39.35 
 
 		 507 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.345291  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0677  threonine dehydratase  39.35 
 
 		 507 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2766  threonine dehydratase  39.35 
 
 		 507 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417211  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2392  threonine dehydratase  39.35 
 
 		 507 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1725  threonine dehydratase  39.35 
 
 		 535 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0662  threonine dehydratase  39.1 
 
 		 507 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1144  threonine dehydratase  38.41 
 
 		 535 aa  226  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15844  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2654  threonine dehydratase  39.64 
 
 		 507 aa  226  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49047  l-threonine ammonia-lyase  39.73 
 
 		 606 aa  224  2e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866709  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  37.56 
 
 		 505 aa  224  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0325  threonine dehydratase  36.93 
 
 		 506 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370445  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>